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出境医 / 临床实验 / 染色体不稳定性是肺癌患者免疫疗法中耐药性的替代生物标志物(Cinsbdrilcp)

染色体不稳定性是肺癌患者免疫疗法中耐药性的替代生物标志物(Cinsbdrilcp)

研究描述
简要摘要:
PD1作为一种免疫检查点抑制剂,为包括患者在内的癌症患者提供了一种新的治疗方法。尽管免疫疗法已被证明有效,但大多数患者因产生主要和获得性抗性的很大比例而无法从中受益。但是,仍然缺乏准确有效的分子生物标志物来准确评估接受免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的患者的耐药性,以便最大程度地提高患者的治疗作用。染色体不稳定性(CIN)是实体瘤最突出和最常见的特征之一,加速了抗癌耐药性的发展,通常会导致治疗失败和疾病复发,这限制了大多数当前治疗的有效性。因此,这项研究的目的是评估用ICI用超敏感性染色体非整倍性检测(UCAD)治疗的肺癌患者的血液中的动态CIN连续监测,以建立新的分子免疫耐药性评估指数。此外,根据动态CIN检测的结果分析了治疗过程中肿瘤克隆的演变与ICI耐药性之间的相关性。这不仅评估了ICI治疗实时的功效,而且还可以更好地理解和克服未来免疫疗法的抗药性机制。

病情或疾病 干预/治疗
肺癌诊断测试:血浆CFDNA CIN的水平

详细说明:

与抗CTLA4相比,针对PD-1/PD-L1轴的免疫检查点抑制剂(ICI)具有较高的响应率和副作用的发病率较低,并且已被证明在许多不同的恶性肿瘤中具有生存优势,这已经是被批准为包括肺癌在内的越来越多的恶性肿瘤的二线或一线治疗。作为罗伯托·费拉拉(Roberto Ferrara)领导的回顾性分析的结果,尽管ICI治疗的疗效在非小细胞肺癌(NSCLC)中很明显,但在不同患者中的疗效和反应性存在显着差异。因此,建立免疫疗法的预测生物标志物是最大化治疗作用和研究耐药性的关键。根据免疫疗法后的临床试验数据,有三个主要组:(1)最初反应并继续反应的人(响应者); (2)从未做出过反应的人(主要抵抗); (3)那些最初反应但最终发展为疾病进展的人(次要抗性)。当然,PD-L1表达是免疫疗法最常见的生物标志物之一,PD-L1表达本身并不能准确预测免疫疗法的反应,因为这是因为该反应许多PD-L1较高的患者对临床治疗没有反应,许多PD-L1较低的患者反应更好。尽管肿瘤突变负担(TMB)用作OPDIVO治疗NSCLC的生物标志物可以更好地区分与PD-L1相比受益的人,但是,TMB作为确定ICI治疗耐药性标准的生物标志物也是由于其参与肿瘤免疫调节的特定机制而受到限制,需要进一步阐明,并使用NGS进行整个外显子组测序分析的TMB检测成本高。

作为实体瘤最突出和最常见的特征之一,染色体不稳定性(CIN)加速了抗癌耐药性的发展,通常会导致治疗衰竭和疾病复发,这限制了大多数当前治疗的有效性。先前的研究表明,CIN通过提供更高水平的遗传多样性来促进多药耐药性的出现,从而导致多药耐药性。在NSCLC中,研究人员发现基因组加倍和持续的动态CIN与肿瘤内异质性有关,并导致CDNA的平行演化,包括CDK4,FOXA1和BCL11A。值得注意的是,该研究发现突变水平的变化一致性,表明肺癌中的CIN比其他突变过程更有可能选择驾驶事件。 CIN使细胞能够进入几种不同的进化轨迹,并适应治疗产生的选择性压力,这是耐药性的基础。基于上述内容,CIN可能成为研究肺癌中ICI耐药性机制的更准确和有效的生物标志物。 NGS技术可以在检测成本降低的同时获得更全面的基因组信息,这使CIT检测通常比通常在患者中评估CIN的鱼更准确,更实用。作为基于NGS技术的新检测方法,已经开发了超敏感的染色体型肾上腺素型检测(UCAD)(UCAD)在我们先前的研究中。其中采用了基于NGS的低覆盖全基因组测序技术来检测患者外周血中的CTDNA,并进行了生物信息学分析以确定恶性(或复发)的风险(或复发)和肿瘤负担的程度。它在辅助诊断,治疗效果监测,复发和转移监测和预后评估中具有重要的临床价值。

这项研究提出,连续动态CIN与肿瘤内的异质性有关,该性驱动了体细胞拷贝数变化(SCNA)的平行演化(SCNA),并通过提供较高水平的肿瘤细胞遗传多样性,从而促进抗药性克隆的出现,从而导致肿瘤细胞的水平。 ICI治疗的患者的药物耐药性。研究人员旨在在二线治疗UCAD治疗后不断监测肺癌患者血液中的动态CIN,以建立新的分子免疫耐药性评估指数。此外,根据动态CIN的检测结果,分析了治疗过程中肿瘤克隆的演变与ICI耐药性之间的相关性。

学习规划
研究信息的布局表
研究类型观察
估计入学人数 40名参与者
观察模型:病例对照
时间观点:预期
官方标题: UCAD检测到的血清染色体不稳定的动态监测
实际学习开始日期 2019年11月10日
估计的初级完成日期 2020年11月11日
估计 学习完成日期 2021年11月11日
武器和干预措施
组/队列 干预/治疗
PD1抗体治疗患者

研究人员将在用PD1抗体治疗前1天(第0天)检测肺癌患者的CFDNA CIN,然后在使用PD1抗体治疗后的第22和第64天以及疾病进展时证实。

分析了CIN和耐药性与PD1抗体的相关性。

诊断测试:血浆CFDNA CIN的水平
UCAD将分析从Pb中提取的CFDNA,以确定CIN的水平。

结果措施
主要结果指标
  1. CINS和治疗结果的一致性是CINS与治疗结果之间的一致性[时间范围:通过研究完成,平均3个月]
    根据患者的临床耐药性与使用UCAD检测的CIN之间的相关分析,发现患者的分层临界值间隔,根据CIN评估将其分为四个治疗结果:明显的疗效,一级耐药性,耐药性耐药性以及可能的超级进步。


次要结果度量
  1. 一致性的CINS和临床监测[时间范围:通过研究完成,平均3个月]
    使用UCAD与RECIST标准分析CIN的动态变化之间的相关性,并比较UCAD和成像测试和血清学之间的时差和准确性。


生物测量保留率:DNA样品
从外周血中提取的无细胞DNA将通过超敏化染色体非整倍性检测来分析,以确定染色体不稳定性的水平。

资格标准
有资格信息的布局表
有资格学习的年龄: 20年至70年(成人,老年人)
有资格学习的男女:全部
接受健康的志愿者:
采样方法:非概率样本
研究人群
从2019年8月到本研究结束,上海肺部医院(SPH)诊断出患有肺癌的患者。
标准

纳入标准:

  • IIIA-IVB期非小细胞肺癌患者没有EGFR,ALK,ROS1,C-MET驱动的基因突变。男性或女性患者20至70岁。
  • 计划接受或不接受化学疗法的患者,包括作为新辅助治疗,接受PD1抗体治疗。
  • 受试者的年龄,性别,婚姻和生殖历史,收集时间,病理学,细胞学和成像诊断已完成。
  • 参与者签署了知情同意书。

排除标准:

  • 有资格通过驱动基因突变进行靶向治疗。
  • 没有根据recist标准而没有可测量的靶病变。
  • 年龄在20岁以下或超过70岁以上。
  • 不愿签署同意书或不愿意提供PB进行测试或不愿提供病历的个人。
联系人和位置

联系人
位置联系人的布局表
联系人:Di Zheng,博士8613801683953 EXT 8613801683953 tulemonarysh_pg@126.com
联系人:Ziliang Qian,博士8615000902318 ziliang.qian@prophetgenomics.com.cn

位置
布局表以获取位置信息
中国,上海
Di Zheng招募
上海上海,中国
联系人:DI DU,博士8615800706091 EXT 8615800706091 Changzheng_pg@163.com
赞助商和合作者
上海上海上海肺部医院
调查人员
调查员信息的布局表
研究主任: Di Zheng,博士上海上海上海肺部医院
追踪信息
首先提交日期2019年12月16日
第一个发布日期2019年12月18日
上次更新发布日期2019年12月24日
实际学习开始日期2019年11月10日
估计的初级完成日期2020年11月11日(主要结果度量的最终数据收集日期)
当前的主要结果指标
(提交:2019年12月16日)
CINS和治疗结果的一致性是CINS与治疗结果之间的一致性[时间范围:通过研究完成,平均3个月]
根据患者的临床耐药性与使用UCAD检测的CIN之间的相关分析,发现患者的分层临界值间隔,根据CIN评估将其分为四个治疗结果:明显的疗效,一级耐药性,耐药性耐药性以及可能的超级进步。
原始主要结果指标与电流相同
改变历史
当前的次要结果指标
(提交:2019年12月16日)
一致性的CINS和临床监测[时间范围:通过研究完成,平均3个月]
使用UCAD与RECIST标准分析CIN的动态变化之间的相关性,并比较UCAD和成像测试和血清学之间的时差和准确性。
原始的次要结果指标与电流相同
当前其他预先指定的结果指标不提供
原始其他预先指定的结果指标不提供
描述性信息
简短标题染色体不稳定性是肺癌患者免疫疗法中耐药性的替代生物标志物
官方头衔UCAD检测到的血清染色体不稳定的动态监测
简要摘要PD1作为一种免疫检查点抑制剂,为包括患者在内的癌症患者提供了一种新的治疗方法。尽管免疫疗法已被证明有效,但大多数患者因产生主要和获得性抗性的很大比例而无法从中受益。但是,仍然缺乏准确有效的分子生物标志物来准确评估接受免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的患者的耐药性,以便最大程度地提高患者的治疗作用。染色体不稳定性(CIN)是实体瘤最突出和最常见的特征之一,加速了抗癌耐药性的发展,通常会导致治疗失败和疾病复发,这限制了大多数当前治疗的有效性。因此,这项研究的目的是评估用ICI用超敏感性染色体非整倍性检测(UCAD)治疗的肺癌患者的血液中的动态CIN连续监测,以建立新的分子免疫耐药性评估指数。此外,根据动态CIN检测的结果分析了治疗过程中肿瘤克隆的演变与ICI耐药性之间的相关性。这不仅评估了ICI治疗实时的功效,而且还可以更好地理解和克服未来免疫疗法的抗药性机制。
详细说明

与抗CTLA4相比,针对PD-1/PD-L1轴的免疫检查点抑制剂(ICI)具有较高的响应率和副作用的发病率较低,并且已被证明在许多不同的恶性肿瘤中具有生存优势,这已经是被批准为包括肺癌在内的越来越多的恶性肿瘤的二线或一线治疗。作为罗伯托·费拉拉(Roberto Ferrara)领导的回顾性分析的结果,尽管ICI治疗的疗效在非小细胞肺癌(NSCLC)中很明显,但在不同患者中的疗效和反应性存在显着差异。因此,建立免疫疗法的预测生物标志物是最大化治疗作用和研究耐药性的关键。根据免疫疗法后的临床试验数据,有三个主要组:(1)最初反应并继续反应的人(响应者); (2)从未做出过反应的人(主要抵抗); (3)那些最初反应但最终发展为疾病进展的人(次要抗性)。当然,PD-L1表达是免疫疗法最常见的生物标志物之一,PD-L1表达本身并不能准确预测免疫疗法的反应,因为这是因为该反应许多PD-L1较高的患者对临床治疗没有反应,许多PD-L1较低的患者反应更好。尽管肿瘤突变负担(TMB)用作OPDIVO治疗NSCLC的生物标志物可以更好地区分与PD-L1相比受益的人,但是,TMB作为确定ICI治疗耐药性标准的生物标志物也是由于其参与肿瘤免疫调节的特定机制而受到限制,需要进一步阐明,并使用NGS进行整个外显子组测序分析的TMB检测成本高。

作为实体瘤最突出和最常见的特征之一,染色体不稳定性(CIN)加速了抗癌耐药性的发展,通常会导致治疗衰竭和疾病复发,这限制了大多数当前治疗的有效性。先前的研究表明,CIN通过提供更高水平的遗传多样性来促进多药耐药性的出现,从而导致多药耐药性。在NSCLC中,研究人员发现基因组加倍和持续的动态CIN与肿瘤内异质性有关,并导致CDNA的平行演化,包括CDK4,FOXA1和BCL11A。值得注意的是,该研究发现突变水平的变化一致性,表明肺癌中的CIN比其他突变过程更有可能选择驾驶事件。 CIN使细胞能够进入几种不同的进化轨迹,并适应治疗产生的选择性压力,这是耐药性的基础。基于上述内容,CIN可能成为研究肺癌中ICI耐药性机制的更准确和有效的生物标志物。 NGS技术可以在检测成本降低的同时获得更全面的基因组信息,这使CIT检测通常比通常在患者中评估CIN的鱼更准确,更实用。作为基于NGS技术的新检测方法,已经开发了超敏感的染色体型肾上腺素型检测(UCAD)(UCAD)在我们先前的研究中。其中采用了基于NGS的低覆盖全基因组测序技术来检测患者外周血中的CTDNA,并进行了生物信息学分析以确定恶性(或复发)的风险(或复发)和肿瘤负担的程度。它在辅助诊断,治疗效果监测,复发和转移监测和预后评估中具有重要的临床价值。

这项研究提出,连续动态CIN与肿瘤内的异质性有关,该性驱动了体细胞拷贝数变化(SCNA)的平行演化(SCNA),并通过提供较高水平的肿瘤细胞遗传多样性,从而促进抗药性克隆的出现,从而导致肿瘤细胞的水平。 ICI治疗的患者的药物耐药性。研究人员旨在在二线治疗UCAD治疗后不断监测肺癌患者血液中的动态CIN,以建立新的分子免疫耐药性评估指数。此外,根据动态CIN的检测结果,分析了治疗过程中肿瘤克隆的演变与ICI耐药性之间的相关性。

研究类型观察
学习规划观察模型:病例对照
时间观点:潜在
目标随访时间不提供
生物测量保留:DNA样品
描述:
从外周血中提取的无细胞DNA将通过超敏化染色体非整倍性检测来分析,以确定染色体不稳定性的水平。
采样方法非概率样本
研究人群从2019年8月到本研究结束,上海肺部医院(SPH)诊断出患有肺癌的患者。
健康)状况肺癌
干涉诊断测试:血浆CFDNA CIN的水平
UCAD将分析从Pb中提取的CFDNA,以确定CIN的水平。
研究组/队列PD1抗体治疗患者

研究人员将在用PD1抗体治疗前1天(第0天)检测肺癌患者的CFDNA CIN,然后在使用PD1抗体治疗后的第22和第64天以及疾病进展时证实。

分析了CIN和耐药性与PD1抗体的相关性。

干预:诊断测试:等离子CFDNA CIN的水平
出版物 *
  • pardoll dm。癌症免疫疗法中免疫检查点的封锁。 Nat Rev Cancer。 2012年3月22日; 12(4):252-64。 doi:10.1038/nrc3239。审查。
  • Brahmer Jr,Tykodi SS,Chow LQ,Hwu WJ,Topalian SL,Hwu P,Drake CG,Camacho LH,Kauh J,Odunsi K,Pitot HC,Pitot HC,Hamid O,Bhatia O,Bhatia S,Martins R,Martins R,Martins R,Eaton K,Eaton S,Chen S,Chen S,Chen S,Salay S,Salay s,Salay s,Salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s,salay s salay s salay s salay tm ,Alaparthy S,Grosso JF,Korman AJ,Parker SM,Agrawal S,Goldberg SM,Pardoll DM,Gupta A,Wigginton JM。晚期癌症患者抗PD-L1抗体的安全性和活性。 N Engl J Med。 2012年6月28日; 366(26):2455-65。 doi:10.1056/nejmoa1200694。 Epub 2012年6月2日。
  • Topalian SL,Hodi FS,JR JR,Geter SN,Smith DC,McDermott DF,Powderly JD,Carvajal RD,Sosman JA,Atkins MB,Leming PD,Spigel DR,Antonia DR,Antonia SJ,Horn L,Drake CG,DRAKE CG,Chen L,Chen L,Chen L DM,Chen L DM,Chen L DM,Chen L DM,Chen L DM,Chen L DM,Chen L DM,Chen l DM,Chen L,Chen L,Chen L,Chen L,Chen L, ,Sharfman WH,Anders RA,Taube JM,McMiller TL,Xu H,Korman AJ,Jure-Kunkel M,Agrawal S,McDonald D,Kollia GD,Gupta A,Wigginton JM,Sznol M.癌症中的抗PD-1抗体。 N Engl J Med。 2012年6月28日; 366(26):2443-54。 doi:10.1056/nejmoa1200690。 Epub 2012年6月2日。
  • 万山,给我打招呼。 Nivolumab与ipilimumab在晚期黑色素瘤治疗中:重要评估:原始文章:Wolchok JD,Chiarion-Sileni V,Gonzalez R等。晚期黑色素瘤中的Nivolumab和ipilimumab联合生存。 N Engl J Med 2017; 377:1345-56。 Br J Dermatol。 2018年8月; 179(2):296-300。 doi:10.1111/bjd.16785。 Epub 2018 Jun 5。
  • Sharma P,Hu-Lieskovan S,Wargo JA,Ribas A.初级,自适应和对癌症免疫疗法的抵抗力。细胞。 2017年2月9日; 168(4):707-723。 doi:10.1016/j.cell.2017.01.017。审查。
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  • Haratani K,Hayashi H,Tanaka T,Kaneda H,Togashi Y,Sakai K,Hayashi K,Tomida S,Chiba Y,Yonesaka K,Yonesaka K,Nonagase Y,Takahama T,Tanizaki J,Tanizaki J,Tanizaki J,Tanaka K,Tanaka K,Tanaka K,Tanaka K,Yoshida T,Tanimura K,Tanimura K,Takeda M M. ,Yoshioka H,Ishida T,Mitsudomi T,Nishio K,Nakagawa K.基于EGFR-TKI治疗期间疾病后T790M状态的EGFR突变阳性非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境和Nivolumab疗效。安·恩科尔(Ann Oncol)。 2017年7月1日; 28(7):1532-1539。 doi:10.1093/annonc/mdx183。
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  • Lee AJ,Endesfelder D,Rowan AJ,Walther A,Birkbak NJ,Futreal PA,Downward J,Szallasi Z,Tomlinson IP,Howell M,Kschischo M,Swanton C. C.染色体不稳定性不稳定Intinsic Multidrug抵抗。癌症。 2011年3月1日; 71(5):1858-70。 doi:10.1158/0008-5472.CAN-10-3604。
  • Kuznetsova AY,Seget K,Moeller GK,De Pagter MS,De Roos JA,DürrbaumM,Kuffer C,MüllerS,Zaman GJ,Kloosterman WP,StorchováZ。人类细胞。细胞周期。 2015; 14(17):2810-20。 doi:10.1080/15384101.2015.1068482。
  • Jamal-Hanjani M,Wilson GA,McGranahan N,Birkbak NJ,Watkins TBK,Veeriah S,Shafi S,Johnson DH,Johnson DH,Mitter R,Rosenthal R,Salm M,Salm M,Horswell S,Escudery S,Escudero M,Matthews N,Matthews N,Rowan A,Rowan A,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T,Chambers T, Moore DA,Turajlic S,Xu H,Lee SM,Forster MD,Ahmad T,Hiley CT,Abbosh C,Falzon M,Borg E,Marafioti T,Marafioti T,Lawrence D,Hayward M,Hayward M,Kovelkar S,Koverkar S,Panagiotopopoulos N,Janes SM,Thakrar R R R R R R R R R R r ,Ahmed A,Blackhall F,Summers Y,Shah R,Joseph L,Quinn AM,Crosbie PA,Naidu B,Middleton G,Langman G,Trotter S,Nicolson M,Nicolson M,Remmen H,Kerr K,Kerr K,Kerr K,Cerr K,Chetty M,Chetty M,Gomersall L,Fennell L,Fennell L,Fennell L,Fennell L,Fennell DA, Nakas A, Rathinam S, Anand G, Khan S, Russell P, Ezhil V, Ismail B, Irvin-Sellers M, Prakash V, Lester JF, Kornaszewska M, Attanoos R, Adams H, Davies H, Dentro S, Taniere P,O'Sullivan B,Lowe HL,Hartley JA,Iles N,Bell H,Ngai Y,Shaw JA,Herrero J,Szallasi Z,Schwarz RF,Stewart A,Stewart A,Quezada SA,Le Quesne J,Le Quesne J,le Quesne J,van van oo p,dive c,潜水C,潜水C,潜水,Hackshaw A,Swanton C; Tracerx财团。跟踪非小细胞肺癌的演变。 N Engl J Med。 2017年6月1日; 376(22):2109-2121。 doi:10.1056/nejmoa1616288。 Epub 2017年4月26日。
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  • Juric D,Castel P,Griffith M,Griffith OL,Won HH,Ellis H,Ebbesen SH,Ainscough BJ,Ramu A,Iyer G,Shah RH,Huynh T,Mino-Kenudson M,Sgroi D,Sgroi D,Sgroi D,Isakoff S,Isakoff S,Thabet A,Thabet A,Thabet A,Thabet A,Thabet Elamine L,Solit DB,Lowe SW,Quadt C,Peters M,Derti A,Schegel R,Huang A,Mardis ER,Berger MF,Berger MF,Baselga J,Scaltriti M. PTEN的收敛损失可导致PI(3) Kα抑制剂。自然。 2015年2月12日; 518(7538):240-4。 doi:10.1038/nature13948。 EPUB 2014 11月17日。
  • Heng HH,Spyropoulos B,Moens PB。染色体和基因组研究中的鱼类技术。生物评估。 1997年1月; 19(1):75-84。审查。

*包括由数据提供商提供的出版物以及Medline中临床标识符(NCT编号)的出版物。
招聘信息
招聘状况招募
估计入学人数
(提交:2019年12月16日)
40
原始估计注册与电流相同
估计学习完成日期2021年11月11日
估计的初级完成日期2020年11月11日(主要结果度量的最终数据收集日期)
资格标准

纳入标准:

  • IIIA-IVB期非小细胞肺癌患者没有EGFR,ALK,ROS1,C-MET驱动的基因突变。男性或女性患者20至70岁。
  • 计划接受或不接受化学疗法的患者,包括作为新辅助治疗,接受PD1抗体治疗。
  • 受试者的年龄,性别,婚姻和生殖历史,收集时间,病理学,细胞学和成像诊断已完成。
  • 参与者签署了知情同意书。

排除标准:

  • 有资格通过驱动基因突变进行靶向治疗。
  • 没有根据recist标准而没有可测量的靶病变。
  • 年龄在20岁以下或超过70岁以上。
  • 不愿签署同意书或不愿意提供PB进行测试或不愿提供病历的个人。
性别/性别
有资格学习的男女:全部
年龄20年至70年(成人,老年人)
接受健康的志愿者
联系人
联系人:Di Zheng,博士8613801683953 EXT 8613801683953 tulemonarysh_pg@126.com
联系人:Ziliang Qian,博士8615000902318 ziliang.qian@prophetgenomics.com.cn
列出的位置国家中国
删除了位置国家
管理信息
NCT编号NCT04203095
其他研究ID编号pH-PG001
有数据监测委员会是的
美国FDA调节的产品
研究美国FDA调节的药物:
研究美国FDA调节的设备产品:
IPD共享声明
计划共享IPD:不确定
责任方中国上海上海肺部医院Di Zheng
研究赞助商上海上海上海肺部医院
合作者不提供
调查人员
研究主任: Di Zheng,博士上海上海上海肺部医院
PRS帐户上海上海上海肺部医院
验证日期2019年12月

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