肺炎是高度免疫功能低下的个体（例如血液学恶性肿瘤和/或造血干细胞移植）的发病率和死亡率的主要原因。这些患者可以被广泛的潜在病原体感染，包括病毒，细菌和真菌病因，有时同时伴有多种病原体。诊断测试通常无法鉴定下呼吸道疾病的微生物病因，即使是支气管肺泡灌洗（BAL）。实际上，BAL样品对BAL样品的培养方法，PCR和抗原测试仅产生了30-67％的时间。此外，特发性肺综合征（IPS）是一种非感染的移植肺并发症，可能患有许多与感染性肺炎的重叠症状。 IPS的治疗方法是可以加剧感染的类固醇。鉴于这些原因，需要更好的诊断来帮助治疗免疫功能低下的肺炎患者。

卡里乌斯（Karius）开发了一种无微生物细胞的下一代测序测试，用于病原体检测，能够检测> 1,000种生物，包括DNA病毒，细菌，酵母，霉菌和其他真核生物病原体。该测试是在CLIA认证/CAP认可的实验室中进行的，其结果通常在样本收据后一天内提供。鉴于需要在该人群中对肺炎进行更敏感的诊断测试，我们正在评估Karius检测的Karius检测性能。

• 肺炎，细菌
• 肺炎，病毒
• 肺炎真菌
• 肺炎腔
• 免疫功能低下的宿主

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纳入标准：

受试者必须符合A节和第C条或第D节中的所有标准中的所有标准。

A节：

1. 患者年龄≥18岁。
2. 目前被送往医院。
3. 具有可疑的感染性肺炎，保证诊断评估和治疗。
4. 已经进行了诊断性支气管镜检查，用于评估肺炎的微生物病因，或者在入学后5天内进行预定的支气管镜检查。
5. 患者或患者的合法授权代表（LAR）已提供了该研究的同意。

B节：

1. 具有以下血液性恶性肿瘤之一：急性淋巴细胞白血病（ALL），急性骨髓性白血病（AML），骨髓增生性症状综合征（MDS），淋巴瘤（任何类型），多发性骨髓瘤（MM），多发性骨髓瘤（MM）或慢性淋巴细胞症（cllonic lymphocytix sll/sll/ ）。

2. 免疫功能低下的定义为至少具有以下一个：

   1. 在过去的45天内接受了化学疗法。
   2. 预计在接下来的45天内将在化疗治疗的血液系统恶性肿瘤复发。
   3. ANC <500至少14天，在入学前8周内。

C节：

1. 对以下血液学恶性肿瘤之一进行了自体造血干细胞移植（例如骨髓移植）：急性淋巴淋巴细胞白血病（ALL），急性骨髓性白血病（AML），肌发育症（Myelodysplastic Cyndromanto（MD），或多型脂肪瘤（Moloty Moryelyelyelyelyellymphastor），或（MM）;），或慢性淋巴细胞性白血病（CLL/SLL）的恶性转化。

2. 免疫功能低下的定义为至少具有以下一个：

   1. 在过去6个月内，经历了自体造血干细胞移植（HSCT）。
   2. 在过去的45天内接受了化学疗法。
   3. 预计在接下来的45天内将在化疗治疗的血液系统恶性肿瘤复发。

D节：

1. 对于任何临床指示，经历了同种异性造血干细胞移植（例如，骨髓移植）。

2. 免疫功能低下的定义为至少具有以下一个：

   1. 在过去的一年中，经历了造血干细胞移植（HCST）。
   2. 患有需要免疫抑制药理治疗的活性移植物与宿主疾病（GVHD）。

排除标准：

1. 患者是垂死的，在治疗医师的看来，预计不会在潜在的学习入学率访问时生存> 24小时。
2. 根据当地护理测试标准，已经确定了指数肺炎事件的微生物病因。
3. 患者先前已入学。
4. 患者的任何条件是，在治疗医师的看来，患者将阻止患者完成研究。 （注意：如果合格的患者拒绝收集探索性研究样本，则可能仍会参加研究。）
5. 在入学前14天内，通过任何分子测试，患者对SARS-COV-2呈阳性。