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出境医 / 临床实验 / 攻击性寡聚胶质瘤(Proglio)的蛋白质组学表征

攻击性寡聚胶质瘤(Proglio)的蛋白质组学表征

研究描述
简要摘要:

少突胶质瘤代表以特定分子改变为特征的成年神经胶质瘤的独特亚组(1p/19q codeletion,IDH,TERT启动子,CIC,FUBP1的突变)。这些肿瘤占成年神经膜瘤的5%至10%,并且在神经肿瘤领域具有特殊相关性,因为它们的化学敏感性频繁(Louis等人,2016年)。少突胶质瘤的遗传学表征相对较好,但对这些肿瘤的肿瘤发生机制知之甚少。

尽管少突胶质瘤预后通常比其他成人神经胶质瘤亚型的预后更好,但它仍然是异质性的,放疗和化学疗法后复发时没有有效的治疗方法。我们最近在印加资助的国家Pola网络中进行的工作将这种临床异质性与肿瘤间异质性有关。基于对一系列少突胶质神经胶质瘤的转录组分析,我们确定了3个亚组,这是以侵略性的临床和分子模式为特征的最激进的组。然而,最近的研究表明,mRNA和蛋白质表达之间的一致性相对较低,强调需要使用基于蛋白质组学的方法更好地了解肿瘤生物学。利用Pola队列的优势,我们建议通过整合少突胶质瘤的蛋白质组学分析来扩展先前的分析。

该项目的目的是鉴定少突可瘤亚组的驱动因素,其中潜在的可药靶标(即受体,代谢效应子)。为此,将生成90个寡聚胶质瘤的蛋白质组学特征,并与转录组,基因组和甲基化曲线集成,以识别与每个亚型特别相关的信号传导途径,尤其是与最激进的信号。将在候选信号通路表达和临床结果(生存,无进展生存期,客观反应)之间探索关联。使用遗传相关的小鼠和异种移植模型,将在体外和体内评估这两种最有前途的候选信号通路的相关性。

我们的项目将确定与不良预后相关的有针对性的致癌途径,这可能导致新的治疗策略。


病情或疾病 干预/治疗
少突胶质瘤其他:蛋白质组学分析

学习规划
研究信息的布局表
研究类型观察
估计入学人数 120名参与者
观察模型:队列
时间观点:回顾
官方标题:侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
实际学习开始日期 2020年9月30日
估计初级完成日期 2021年9月
估计 学习完成日期 2023年9月
武器和干预措施
小组/队列 干预/治疗
O1
30例患者的少突胶质瘤样品的更具侵略性的亚组
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

O2
30例患者的少突胶质瘤样品的亚组2
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

O3
30例患者的少突胶质瘤样品的亚组3
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

IDH突变的星形胶质细胞瘤
IDH突变的星形胶质细胞瘤的患者,15例患者的样本
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

IDH WildType胶质母细胞瘤
IDH WildType胶质母细胞瘤的患者,15例患者的样本
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

结果措施
主要结果指标
  1. 蛋白质组学特征[时间范围:基线(在诊断手术时)]
    基于其蛋白质组学特征与我们先前鉴定的寡头子亚组的蛋白质组学特征的分类一致性。


生物测量保留率:DNA样品
肿瘤样本和血液

资格标准
有资格信息的布局表
符合研究资格的年龄:儿童,成人,老年人
有资格学习的男女:全部
接受健康的志愿者:是的
采样方法:非概率样本
研究人群
Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库(Institut du Cerveau et la Moelleépiniière),可在Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库中使用的少突胶质瘤,星形细胞瘤胶质母细胞瘤和正常脑的患者样本
标准

纳入标准:

  • - 可用或可能获得的转录组(微阵列)数据,
  • 可用或可能获得的甲基化(450k)数据,
  • 可用或可能获取它们的基因组(SNP数组)数据,
  • 足够的蛋白质组学分析材料(冷冻肿瘤样品)

排除标准:

  • 反对患者
联系人和位置

联系人
位置联系人的布局表
联系人:医学博士FrançoisDucray 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr

位置
位置表的布局表
法国
Groupement Hospitionier EST HCL招募
布朗,法国
联系人:FrançoisDucray,MD 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr
杜塞沃(Du Cerveau)等人尚未招募
法国巴黎
赞助商和合作者
里昂的临终关怀
追踪信息
首先提交日期2020年12月17日
第一个发布日期2021年4月13日
最后更新发布日期2021年4月13日
实际学习开始日期2020年9月30日
估计初级完成日期2021年9月(主要结果指标的最终数据收集日期)
当前的主要结果指标
(提交:2021年4月12日)
蛋白质组学特征[时间范围:基线(在诊断手术时)]
基于其蛋白质组学特征与我们先前鉴定的寡头子亚组的蛋白质组学特征的分类一致性。
原始主要结果指标与电流相同
改变历史没有发布更改
当前的次要结果指标不提供
原始的次要结果指标不提供
当前其他预先指定的结果指标不提供
其他其他预先指定的结果指标不提供
描述性信息
简短标题侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
官方头衔侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
简要摘要

少突胶质瘤代表以特定分子改变为特征的成年神经胶质瘤的独特亚组(1p/19q codeletion,IDH,TERT启动子,CIC,FUBP1的突变)。这些肿瘤占成年神经膜瘤的5%至10%,并且在神经肿瘤领域具有特殊相关性,因为它们的化学敏感性频繁(Louis等人,2016年)。少突胶质瘤的遗传学表征相对较好,但对这些肿瘤的肿瘤发生机制知之甚少。

尽管少突胶质瘤预后通常比其他成人神经胶质瘤亚型的预后更好,但它仍然是异质性的,放疗和化学疗法后复发时没有有效的治疗方法。我们最近在印加资助的国家Pola网络中进行的工作将这种临床异质性与肿瘤间异质性有关。基于对一系列少突胶质神经胶质瘤的转录组分析,我们确定了3个亚组,这是以侵略性的临床和分子模式为特征的最激进的组。然而,最近的研究表明,mRNA和蛋白质表达之间的一致性相对较低,强调需要使用基于蛋白质组学的方法更好地了解肿瘤生物学。利用Pola队列的优势,我们建议通过整合少突胶质瘤的蛋白质组学分析来扩展先前的分析。

该项目的目的是鉴定少突可瘤亚组的驱动因素,其中潜在的可药靶标(即受体,代谢效应子)。为此,将生成90个寡聚胶质瘤的蛋白质组学特征,并与转录组,基因组和甲基化曲线集成,以识别与每个亚型特别相关的信号传导途径,尤其是与最激进的信号。将在候选信号通路表达和临床结果(生存,无进展生存期,客观反应)之间探索关联。使用遗传相关的小鼠和异种移植模型,将在体外和体内评估这两种最有前途的候选信号通路的相关性。

我们的项目将确定与不良预后相关的有针对性的致癌途径,这可能导致新的治疗策略。

详细说明不提供
研究类型观察
学习规划观察模型:队列
时间视角:回顾
目标随访时间不提供
生物测量保留:DNA样品
描述:
肿瘤样本和血液
采样方法非概率样本
研究人群Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库(Institut du Cerveau et la Moelleépiniière),可在Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库中使用的少突胶质瘤,星形细胞瘤胶质母细胞瘤和正常脑的患者样本
健康)状况少突胶质瘤
干涉其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析
研究组/队列
  • O1
    30例患者的少突胶质瘤样品的更具侵略性的亚组
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • O2
    30例患者的少突胶质瘤样品的亚组2
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • O3
    30例患者的少突胶质瘤样品的亚组3
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • IDH突变的星形胶质细胞瘤
    IDH突变的星形胶质细胞瘤的患者,15例患者的样本
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • IDH WildType胶质母细胞瘤
    IDH WildType胶质母细胞瘤的患者,15例患者的样本
    干预:其他:蛋白质组学分析
出版物 *不提供

*包括数据提供商提供的出版物以及MEDLINE中临床标识符(NCT编号)确定的出版物。
招聘信息
招聘状况招募
估计入学人数
(提交:2021年4月12日)
120
原始估计注册与电流相同
估计学习完成日期2023年9月
估计初级完成日期2021年9月(主要结果指标的最终数据收集日期)
资格标准

纳入标准:

  • - 可用或可能获得的转录组(微阵列)数据,
  • 可用或可能获得的甲基化(450k)数据,
  • 可用或可能获取它们的基因组(SNP数组)数据,
  • 足够的蛋白质组学分析材料(冷冻肿瘤样品)

排除标准:

  • 反对患者
性别/性别
有资格学习的男女:全部
年龄儿童,成人,老年人
接受健康的志愿者是的
联系人
联系人:医学博士FrançoisDucray 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr
列出的位置国家法国
删除了位置国家
管理信息
NCT编号NCT04843085
其他研究ID编号69HCL20_0074
有数据监测委员会不提供
美国FDA调节的产品
研究美国FDA调节的药物:
研究美国FDA调节的设备产品:
IPD共享声明不提供
责任方里昂的临终关怀
研究赞助商里昂的临终关怀
合作者不提供
调查人员不提供
PRS帐户里昂的临终关怀
验证日期2020年12月
研究描述
简要摘要:

少突胶质瘤代表以特定分子改变为特征的成年神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤的独特亚组(1p/19q codeletion,IDH,TERT启动子,CIC,FUBP1的突变)。这些肿瘤占成年神经膜瘤的5%至10%,并且在神经肿瘤领域具有特殊相关性,因为它们的化学敏感性频繁(Louis等人,2016年)。少突胶质瘤的遗传学表征相对较好,但对这些肿瘤的肿瘤发生机制知之甚少。

尽管少突胶质瘤预后通常比其他成人神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤亚型的预后更好,但它仍然是异质性的,放疗和化学疗法后复发时没有有效的治疗方法。我们最近在印加资助的国家Pola网络中进行的工作将这种临床异质性与肿瘤间异质性有关。基于对一系列少突胶质神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤的转录组分析,我们确定了3个亚组,这是以侵略性的临床和分子模式为特征的最激进的组。然而,最近的研究表明,mRNA和蛋白质表达之间的一致性相对较低,强调需要使用基于蛋白质组学的方法更好地了解肿瘤生物学。利用Pola队列的优势,我们建议通过整合少突胶质瘤的蛋白质组学分析来扩展先前的分析。

该项目的目的是鉴定少突可瘤亚组的驱动因素,其中潜在的可药靶标(即受体,代谢效应子)。为此,将生成90个寡聚胶质瘤的蛋白质组学特征,并与转录组,基因组和甲基化曲线集成,以识别与每个亚型特别相关的信号传导途径,尤其是与最激进的信号。将在候选信号通路表达和临床结果(生存,无进展生存期,客观反应)之间探索关联。使用遗传相关的小鼠和异种移植模型,将在体外和体内评估这两种最有前途的候选信号通路的相关性。

我们的项目将确定与不良预后相关的有针对性的致癌途径,这可能导致新的治疗策略。


病情或疾病 干预/治疗
少突胶质瘤其他:蛋白质组学分析

学习规划
研究信息的布局表
研究类型观察
估计入学人数 120名参与者
观察模型:队列
时间观点:回顾
官方标题:侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
实际学习开始日期 2020年9月30日
估计初级完成日期 2021年9月
估计 学习完成日期 2023年9月
武器和干预措施
小组/队列 干预/治疗
O1
30例患者的少突胶质瘤样品的更具侵略性的亚组
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

O2
30例患者的少突胶质瘤样品的亚组2
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

O3
30例患者的少突胶质瘤样品的亚组3
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

IDH突变的星形胶质细胞瘤
IDH突变的星形胶质细胞瘤的患者,15例患者的样本
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

IDH WildType胶质母细胞瘤
IDH WildType胶质母细胞瘤的患者,15例患者的样本
其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析

结果措施
主要结果指标
  1. 蛋白质组学特征[时间范围:基线(在诊断手术时)]
    基于其蛋白质组学特征与我们先前鉴定的寡头子亚组的蛋白质组学特征的分类一致性。


生物测量保留率:DNA样品
肿瘤样本和血液

资格标准
有资格信息的布局表
符合研究资格的年龄:儿童,成人,老年人
有资格学习的男女:全部
接受健康的志愿者:是的
采样方法:非概率样本
研究人群
Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库(Institut du Cerveau et la Moelleépiniière),可在Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库中使用的少突胶质瘤,星形细胞瘤胶质母细胞瘤和正常脑的患者样本
标准

纳入标准:

  • - 可用或可能获得的转录组(微阵列)数据,
  • 可用或可能获得的甲基化(450k)数据,
  • 可用或可能获取它们的基因组(SNP数组)数据,
  • 足够的蛋白质组学分析材料(冷冻肿瘤样品)

排除标准:

  • 反对患者
联系人和位置

联系人
位置联系人的布局表
联系人:医学博士FrançoisDucray 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr

位置
位置表的布局表
法国
Groupement Hospitionier EST HCL招募
布朗,法国
联系人:FrançoisDucray,MD 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr
杜塞沃(Du Cerveau)等人尚未招募
法国巴黎
赞助商和合作者
里昂的临终关怀
追踪信息
首先提交日期2020年12月17日
第一个发布日期2021年4月13日
最后更新发布日期2021年4月13日
实际学习开始日期2020年9月30日
估计初级完成日期2021年9月(主要结果指标的最终数据收集日期)
当前的主要结果指标
(提交:2021年4月12日)
蛋白质组学特征[时间范围:基线(在诊断手术时)]
基于其蛋白质组学特征与我们先前鉴定的寡头子亚组的蛋白质组学特征的分类一致性。
原始主要结果指标与电流相同
改变历史没有发布更改
当前的次要结果指标不提供
原始的次要结果指标不提供
当前其他预先指定的结果指标不提供
其他其他预先指定的结果指标不提供
描述性信息
简短标题侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
官方头衔侵袭性寡聚胶质瘤的蛋白质组学表征
简要摘要

少突胶质瘤代表以特定分子改变为特征的成年神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤的独特亚组(1p/19q codeletion,IDH,TERT启动子,CIC,FUBP1的突变)。这些肿瘤占成年神经膜瘤的5%至10%,并且在神经肿瘤领域具有特殊相关性,因为它们的化学敏感性频繁(Louis等人,2016年)。少突胶质瘤的遗传学表征相对较好,但对这些肿瘤的肿瘤发生机制知之甚少。

尽管少突胶质瘤预后通常比其他成人神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤亚型的预后更好,但它仍然是异质性的,放疗和化学疗法后复发时没有有效的治疗方法。我们最近在印加资助的国家Pola网络中进行的工作将这种临床异质性与肿瘤间异质性有关。基于对一系列少突胶质神经胶质瘤' target='_blank'>神经胶质瘤的转录组分析,我们确定了3个亚组,这是以侵略性的临床和分子模式为特征的最激进的组。然而,最近的研究表明,mRNA和蛋白质表达之间的一致性相对较低,强调需要使用基于蛋白质组学的方法更好地了解肿瘤生物学。利用Pola队列的优势,我们建议通过整合少突胶质瘤的蛋白质组学分析来扩展先前的分析。

该项目的目的是鉴定少突可瘤亚组的驱动因素,其中潜在的可药靶标(即受体,代谢效应子)。为此,将生成90个寡聚胶质瘤的蛋白质组学特征,并与转录组,基因组和甲基化曲线集成,以识别与每个亚型特别相关的信号传导途径,尤其是与最激进的信号。将在候选信号通路表达和临床结果(生存,无进展生存期,客观反应)之间探索关联。使用遗传相关的小鼠和异种移植模型,将在体外和体内评估这两种最有前途的候选信号通路的相关性。

我们的项目将确定与不良预后相关的有针对性的致癌途径,这可能导致新的治疗策略。

详细说明不提供
研究类型观察
学习规划观察模型:队列
时间视角:回顾
目标随访时间不提供
生物测量保留:DNA样品
描述:
肿瘤样本和血液
采样方法非概率样本
研究人群Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库(Institut du Cerveau et la Moelleépiniière),可在Pola网络生物银行或Onconeurotek肿瘤库中使用的少突胶质瘤,星形细胞瘤胶质母细胞瘤和正常脑的患者样本
健康)状况少突胶质瘤
干涉其他:蛋白质组学分析
:在少突胶质瘤(O1,O2和O3)的3个亚组以及IDH-突变体星形胶质细胞瘤,IDH WildType胶质母细胞瘤和正常脑样品的3个亚组中的蛋白质组学分析
研究组/队列
  • O1
    30例患者的少突胶质瘤样品的更具侵略性的亚组
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • O2
    30例患者的少突胶质瘤样品的亚组2
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • O3
    30例患者的少突胶质瘤样品的亚组3
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • IDH突变的星形胶质细胞瘤
    IDH突变的星形胶质细胞瘤的患者,15例患者的样本
    干预:其他:蛋白质组学分析
  • IDH WildType胶质母细胞瘤
    IDH WildType胶质母细胞瘤的患者,15例患者的样本
    干预:其他:蛋白质组学分析
出版物 *不提供

*包括数据提供商提供的出版物以及MEDLINE中临床标识符(NCT编号)确定的出版物。
招聘信息
招聘状况招募
估计入学人数
(提交:2021年4月12日)
120
原始估计注册与电流相同
估计学习完成日期2023年9月
估计初级完成日期2021年9月(主要结果指标的最终数据收集日期)
资格标准

纳入标准:

  • - 可用或可能获得的转录组(微阵列)数据,
  • 可用或可能获得的甲基化(450k)数据,
  • 可用或可能获取它们的基因组(SNP数组)数据,
  • 足够的蛋白质组学分析材料(冷冻肿瘤样品)

排除标准:

  • 反对患者
性别/性别
有资格学习的男女:全部
年龄儿童,成人,老年人
接受健康的志愿者是的
联系人
联系人:医学博士FrançoisDucray 04 72 35 78 06 francois.ducray@chu-lyon.fr
列出的位置国家法国
删除了位置国家
管理信息
NCT编号NCT04843085
其他研究ID编号69HCL20_0074
有数据监测委员会不提供
美国FDA调节的产品
研究美国FDA调节的药物:
研究美国FDA调节的设备产品:
IPD共享声明不提供
责任方里昂的临终关怀
研究赞助商里昂的临终关怀
合作者不提供
调查人员不提供
PRS帐户里昂的临终关怀
验证日期2020年12月