• 人畜共患感染的诊断[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  将检查诊断的分子模式，以提高敏感性和诊断时间
• 临床结果 - 复发[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  评估6个月内感染复发
• 临床结局 - 症状解决方案[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后一年将审查病历一年]
  症状解决的时间
• 临床结局 - 抗生素使用[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后将审查病历一年]
  在研究期间，复发抗生素的使用

• 人畜共患感染的诊断[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  将检查诊断的分子模式，以提高敏感性和诊断时间
• 临床结果[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后的病历将一年进行审查]
  问卷和医学图表的审查将用于评估症状或感染复发的临床结果

人畜共患病在以色列南部包括布鲁氏菌病和立克感染，是导致传染性发病率的主要因素。贝都因人是居住在内盖（Negev）地区的游牧部落人口，显然暴露于牲畜，骆驼和伴侣动物在内的家养动物，尤其是在不同的贝都因人社区的卫生条件下，也使他们暴露于啮齿动物和疾病矢量，例如作为昆虫和节肢动物。在这项研究中，我们旨在确定到达索罗卡大学医学中心的贝都因人的患者，该中心是内盖夫的三级医院，发烧未分化，被怀疑是人畜共患病。

我们打算使用分子方法使用全血和血清样品更好地诊断感染剂，并在可用的其他组织或体液时，并使用下一代测序技术来深入研究细菌特征，例如毒力因子和宿主病原体相互作用。

这项研究旨在将高级技术应用于贝都因人群中的高温疾病的调查，以改善实验室诊断，以迅速和敏感性来改善我们对贝都因人种群中传染病的病理生理学的理解，包括各种环境暴露，包括各种环境暴露作为动物，水，废物和抗生素暴露，以及与病原体毒力相关的宿主病原体相互作用，与慢性和复发有关的因素以及对治疗的反应。

研究方案：

注册：

1. 筛查后，将接触患者，并提供参加研究的机会。
2. 签署知情同意书后，将接受采访，并填写入学率调查表。
3. 如果将患者纳入ED，则将收集血液，唾液和粪便样本。如果患者出现了皮疹或皮肤病变，将获得开放性病变的拭子。
4. 如果患者接受抗生素后入学，我们还将尝试在接受抗生素之前在ED中找到剩余的血液样本。

跟进：

• 住院期间：

  • 住院或出院当天（以先到者为准）的七天，将尝试获得第二组样品（血液，唾液和粪便），并将从有关症状解决方案的医疗记录中获取临床数据，在住院期间进行诊断或治疗目的的任何手术程序（例如皮肤活检，骨骼活检，关节色素，腰椎穿刺）进行的任何手术程序，任何被认为是不必要的临床目的的剩余材料，都将用于分析。
  • 在住院期间，将面试患者，并将填写洗水（水，卫生和卫生）问卷。

• 入院后的门诊后续行动：

  • 如果在传染病诊所（或SUMC的门诊服务中的任何其他计划访问）进行预定的后续访问，则如果进行了血液采样，则将尝试以研究目的获取全血和血清样本。如果研究指定的血液采样不可行，则将使用剩余的材料来进行研究。如果认为临床相关，则将填写后续调查表。

• 研究期内的复发住院

  o如果在入学后的一年进行了反复入院，则研究小组将评估住院治疗与原始诊断的“相关”或“无关”。如果认为与研究的疾病或其并发症有关，将尝试进行另一种血液采样，并将使用其他身体部位的临床抽样（活检，手术干预或排水）进行任何剩余的材料进行分析。如果认为临床相关，则将填写后续调查表。由于将住院治疗作为研究的一部分进行了分析，因此它们不会被视为严重的不良事件（SAE）。

• 入学六个月后：

  o建立临床结果的电话访谈（附录中附带的协议）。

• 学习期末：

  • 入学后一年，有关抗生素使用的数据，复发住院治疗以及长期并发症将从患者的医疗文件中收集。

样品采集：

参加这项研究的每个患者都会进行以下检查：

血液采样：

入学时将获得全血和血清样本，如果可能的话，将在出院和所有计划的门诊门诊就诊或复发住院治疗。如果由于阳性测试结果，患者在住院期间入学，则在抗生素治疗之前获得的临床非研究样本中的剩余剩余剩余剩余剩余剩余剩余的剩余剩余剩余物品可能用于研究目的，只要不需要临床用途，在相关医院实验室中存储的通常时间范围内。在每个时间点获得的最大血液量为成人10 mL，儿童为5 mL。

其他临床抽样：

在入学时，将获得唾液和粪便样品进行微生物学分析，包括微生物组分析，任何皮疹或伤口采样也将通过分子和元基因组方法进行分析，以诊断罪魁祸首。

样本处理和分析：

所有样品将在NEGEV的本古里昂大学卫生科学学院的Moran-Gilad实验室存储，在入学后五年。样品的处理将分批进行，因此不会实时进行，因此不会产生任何可能影响临床决策的实时数据。分析的结果将无法用于治疗医师。为了细菌基因组/宏基因组测序，将从全血样品中提取DNA，并且只能从提取的材料中鉴定并分析微生物DNA。在这项研究中，不会对人DNA进行研究。将分析在标准培养物中生长的细菌分离株以进一步表征（例如毒力）。通过包括组织培养物（包括组织培养物）来分析宿主 - 病原体相互作用，将进一步分析通过标准培养物鉴定出的布鲁氏菌或其他细菌分离株。临床样品中的免疫反应将分析宿主炎症信号（例如基因表达，蛋白质的测量）。为了提高诊断能力，将对全血样品进行人畜共患病（例如布鲁氏菌，立克和Q发烧或其他）的特定PCR测试，试图检查其效用和与其他诊断手段的效用，与将使用血清样品进行的血清学检查相比。所有样品将根据适当的生物安全水平和良好的实验室实践进行分析。

元数据的收集和患者信息将要求所有患者填写有关其当前疾病细节（希伯来语和阿拉伯语）及其生活条件和暴露于动物的调查表。

元数据包括人口统计数据，健康状况，包括慢性医疗疾病以及先前的住院治疗，过去的人畜共患病史将从医疗记录中收集。在住院期间，将收集以下参数：生命体征，包括时间，直到消除发烧，实验室测试和成像结果以及任何手术程序或重症监护病房的停留。

在入学后的一年中，还将从患者的病历中收集数据，以了解与临床结果相关的因素，包括：复发性住院，抗生素消耗，跟踪血液检查结果，例如炎症标记，血液计数，肝脏酶，并遵循肝脏酶，并遵循提高血清学测试。

研究期和规模这项研究旨在从2020年9月开始在三年内包括总共500名患者。

道德考虑和数据安全所有参与研究的患者将分配一个串行研究编号。在这项研究中收集的所有样品都将标记为研究编号，并且在收集的样品上没有其他识别信息。包含元数据和问卷的文件也将使用研究编号标记。包含识别数据的知情同意书将仅保存在研究团队访问的锁定办公室中，并且编码文件匹配的识别材料与研究编号将在医院计算机上保存在受密码保护的服务器上。识别数据将用于研究期结束时的后续电话访谈，然后使用研究代码将所有获得的信息取消识别和存储。所有数据将使用REDCAP安全的Web应用程序存储。

• 布鲁氏菌病
• 动物源性感染病

纳入标准：

• - 愿意并且能够提供知情同意（如果儿童，法定监护人愿意提供知情同意）
• 在研究期间，所有贝都因人起源的患者都到达了总和：
• 发烧> 38.1（已记录或报告），没有明显的感染来源以及以下迹象或症状之一
• 头痛
• 皮疹
• 关节痛，关节炎
• 弱点
• 肌痛
• 附睾炎
• 白细胞减少症，血小板减少症，肝酶升高
• 其他提示人畜共动感染的发现
• 住院前或住院期间被诊断出患有人畜共患感染的患者。

排除标准：

• - 具有人畜共患病（例如尿路感染，肺炎，上呼吸道感染）或发烧的非感染原因（恶性，风湿病等）以外的已建立感染来源的患者。
• 孕妇
• 儿童重量小于6.5公斤

• 人畜共患感染的诊断[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  将检查诊断的分子模式，以提高敏感性和诊断时间
• 临床结果 - 复发[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  评估6个月内感染复发
• 临床结局 - 症状解决方案[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后一年将审查病历一年]
  症状解决的时间
• 临床结局 - 抗生素使用[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后将审查病历一年]
  在研究期间，复发抗生素的使用

• 人畜共患感染的诊断[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访]
  将检查诊断的分子模式，以提高敏感性和诊断时间
• 临床结果[时间范围：入学后的患者将接受6个月的随访，入学后的病历将一年进行审查]
  问卷和医学图表的审查将用于评估症状或感染复发的临床结果

人畜共患病在以色列南部包括布鲁氏菌病和立克感染，是导致传染性发病率的主要因素。贝都因人是居住在内盖（Negev）地区的游牧部落人口，显然暴露于牲畜，骆驼和伴侣动物在内的家养动物，尤其是在不同的贝都因人社区的卫生条件下，也使他们暴露于啮齿动物和疾病矢量，例如作为昆虫和节肢动物。在这项研究中，我们旨在确定到达索罗卡大学医学中心的贝都因人的患者，该中心是内盖夫的三级医院，发烧未分化，被怀疑是人畜共患病。

我们打算使用分子方法使用全血和血清样品更好地诊断感染剂，并在可用的其他组织或体液时，并使用下一代测序技术来深入研究细菌特征，例如毒力因子和宿主病原体相互作用。

这项研究旨在将高级技术应用于贝都因人群中的高温疾病的调查，以改善实验室诊断，以迅速和敏感性来改善我们对贝都因人种群中传染病的病理生理学的理解，包括各种环境暴露，包括各种环境暴露作为动物，水，废物和抗生素暴露，以及与病原体毒力相关的宿主病原体相互作用，与慢性和复发有关的因素以及对治疗的反应。

研究方案：

注册：

1. 筛查后，将接触患者，并提供参加研究的机会。
2. 签署知情同意书后，将接受采访，并填写入学率调查表。
3. 如果将患者纳入ED，则将收集血液，唾液和粪便样本。如果患者出现了皮疹或皮肤病变，将获得开放性病变的拭子。
4. 如果患者接受抗生素后入学，我们还将尝试在接受抗生素之前在ED中找到剩余的血液样本。

跟进：

• 住院期间：

  • 住院或出院当天（以先到者为准）的七天，将尝试获得第二组样品（血液，唾液和粪便），并将从有关症状解决方案的医疗记录中获取临床数据，在住院期间进行诊断或治疗目的的任何手术程序（例如皮肤活检，骨骼活检，关节色素，腰椎穿刺）进行的任何手术程序，任何被认为是不必要的临床目的的剩余材料，都将用于分析。
  • 在住院期间，将面试患者，并将填写洗水（水，卫生和卫生）问卷。

• 入院后的门诊后续行动：

  • 如果在传染病诊所（或SUMC的门诊服务中的任何其他计划访问）进行预定的后续访问，则如果进行了血液采样，则将尝试以研究目的获取全血和血清样本。如果研究指定的血液采样不可行，则将使用剩余的材料来进行研究。如果认为临床相关，则将填写后续调查表。

• 研究期内的复发住院

  o如果在入学后的一年进行了反复入院，则研究小组将评估住院治疗与原始诊断的“相关”或“无关”。如果认为与研究的疾病或其并发症有关，将尝试进行另一种血液采样，并将使用其他身体部位的临床抽样（活检，手术干预或排水）进行任何剩余的材料进行分析。如果认为临床相关，则将填写后续调查表。由于将住院治疗作为研究的一部分进行了分析，因此它们不会被视为严重的不良事件（SAE）。

• 入学六个月后：

  o建立临床结果的电话访谈（附录中附带的协议）。

• 学习期末：

  • 入学后一年，有关抗生素使用的数据，复发住院治疗以及长期并发症将从患者的医疗文件中收集。

样品采集：

参加这项研究的每个患者都会进行以下检查：

血液采样：

入学时将获得全血和血清样本，如果可能的话，将在出院和所有计划的门诊门诊就诊或复发住院治疗。如果由于阳性测试结果，患者在住院期间入学，则在抗生素治疗之前获得的临床非研究样本中的剩余剩余剩余剩余剩余剩余剩余的剩余剩余剩余物品可能用于研究目的，只要不需要临床用途，在相关医院实验室中存储的通常时间范围内。在每个时间点获得的最大血液量为成人10 mL，儿童为5 mL。

其他临床抽样：

在入学时，将获得唾液和粪便样品进行微生物学分析，包括微生物组分析，任何皮疹或伤口采样也将通过分子和元基因组方法进行分析，以诊断罪魁祸首。

样本处理和分析：

所有样品将在NEGEV的本古里昂大学卫生科学学院的Moran-Gilad实验室存储，在入学后五年。样品的处理将分批进行，因此不会实时进行，因此不会产生任何可能影响临床决策的实时数据。分析的结果将无法用于治疗医师。为了细菌基因组/宏基因组测序，将从全血样品中提取DNA，并且只能从提取的材料中鉴定并分析微生物DNA。在这项研究中，不会对人DNA进行研究。将分析在标准培养物中生长的细菌分离株以进一步表征（例如毒力）。通过包括组织培养物（包括组织培养物）来分析宿主 - 病原体相互作用，将进一步分析通过标准培养物鉴定出的布鲁氏菌或其他细菌分离株。临床样品中的免疫反应将分析宿主炎症信号（例如基因表达，蛋白质的测量）。为了提高诊断能力，将对全血样品进行人畜共患病（例如布鲁氏菌，立克和Q发烧或其他）的特定PCR测试，试图检查其效用和与其他诊断手段的效用，与将使用血清样品进行的血清学检查相比。所有样品将根据适当的生物安全水平和良好的实验室实践进行分析。

元数据的收集和患者信息将要求所有患者填写有关其当前疾病细节（希伯来语和阿拉伯语）及其生活条件和暴露于动物的调查表。

元数据包括人口统计数据，健康状况，包括慢性医疗疾病以及先前的住院治疗，过去的人畜共患病史将从医疗记录中收集。在住院期间，将收集以下参数：生命体征，包括时间，直到消除发烧，实验室测试和成像结果以及任何手术程序或重症监护病房的停留。

在入学后的一年中，还将从患者的病历中收集数据，以了解与临床结果相关的因素，包括：复发性住院，抗生素消耗，跟踪血液检查结果，例如炎症标记，血液计数，肝脏酶，并遵循肝脏酶，并遵循提高血清学测试。

研究期和规模这项研究旨在从2020年9月开始在三年内包括总共500名患者。

道德考虑和数据安全所有参与研究的患者将分配一个串行研究编号。在这项研究中收集的所有样品都将标记为研究编号，并且在收集的样品上没有其他识别信息。包含元数据和问卷的文件也将使用研究编号标记。包含识别数据的知情同意书将仅保存在研究团队访问的锁定办公室中，并且编码文件匹配的识别材料与研究编号将在医院计算机上保存在受密码保护的服务器上。识别数据将用于研究期结束时的后续电话访谈，然后使用研究代码将所有获得的信息取消识别和存储。所有数据将使用REDCAP安全的Web应用程序存储。

• 布鲁氏菌病
• 动物源性感染病

纳入标准：

• - 愿意并且能够提供知情同意（如果儿童，法定监护人愿意提供知情同意）
• 在研究期间，所有贝都因人起源的患者都到达了总和：
• 发烧> 38.1（已记录或报告），没有明显的感染来源以及以下迹象或症状之一
• 头痛
• 皮疹
• 关节痛，关节炎' target='_blank'>关节炎
• 弱点
• 肌痛
• 附睾炎
• 白细胞减少症，血小板减少症，肝酶升高
• 其他提示人畜共动感染的发现
• 住院前或住院期间被诊断出患有人畜共患感染的患者。

排除标准：

• - 具有人畜共患病（例如尿路感染，肺炎，上呼吸道感染）或发烧的非感染原因（恶性，风湿病' target='_blank'>风湿病等）以外的已建立感染来源的患者。
• 孕妇
• 儿童重量小于6.5公斤