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出境医 / 临床实验 / 遗传易感性对严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）（Covidgen）
遗传易感性对严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）（Covidgen）
研究描述
简要摘要：
该项目的这一部分的主要目的是确定在正在进行的SARS-COV2（HCOVID-19）流行的背景下，鉴定SARS-COV2（COVID-19）感染的良性和严重形式的种系遗传因素。该项目的科学论证在附录中描述。我们假设在编码宿主病原体相互作用涉及的关键因素的基因中的病原变异可以解释某些患者对严重疾病的敏感性，即使在没有合并症的情况下也是如此。面临的挑战是确定可能是相关呼吸窘迫并可能进一步死亡的遗传因素。基于我们先前在结节病中的经验，一种多因素疾病易受机会性感染，我们将特别关注凋亡和自噬的调节，对病毒感染的免疫反应以及内质网应激反应（ER应激）（ER应激），这与凋亡密切相关。此类途径中的遗传缺陷可能会降低病毒颗粒的清除率，并诱导SARS-COV2和肺实质的破坏。我们的策略将与我们以前关于结节病的研究中所描述的相似，最近发表了。我们将通过整个外显子组测序（WES）结合了对SARS-COV2感染的良性和严重形式的基因型分析（WES），这是通过传染病专家定义的临床亚组和对基因分享致病变异板鉴定的功能网络的生物信息信息分析的作用。并区分严重的疾病形式。将仔细分析WES数据，并与所有细胞内生理过程以及涉及宿主 - 病原体相互作用的功能途径相关：细胞表面上的病毒靶标和下游信号，病毒基因组RNA复制以及新病毒颗粒的翻译，生产和释放。最后，我们的主要目标是基因面板的定义，与严重的感染形式更具体地相关，以及与SARS-COV2疾病贬值形式有关的有缺陷途径的表征，以识别推定的治疗靶标。
| 病情或疾病 | 干预/治疗 |
|---|---|
| 新冠肺炎 | 遗传：遗传 |
学习规划
| 研究类型 ： | 观察 |
| 估计入学人数 ： | 40名参与者 |
| 观察模型： | 案例对照 |
| 时间观点： | 回顾 |
| 官方标题： | 对无合并性患者的严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）的遗传倾向 |
| 估计研究开始日期 ： | 2020年12月1日 |
| 估计初级完成日期 ： | 2021年6月1日 |
| 估计 学习完成日期 ： | 2021年12月1日 |
武器和干预措施
| 小组/队列 | 干预/治疗 |
|---|---|
| 严重 受SARS-COV2感染影响的患者需要氧气互补和重症监护支持 - 标准18-70岁，没有任何合并症 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA |
| 控制 受SARS-COV2影响的患者，如PCR和/或抗原测试诊断所示，没有任何或较小的临床表达 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA |
结果措施
主要结果指标 ：
- 数据评估的主要标准[时间范围：通过研究完成，平均6个月]严重组中受致病变异影响影响的基因数量，并且在对照组中未观察到对对照组中的每个基因共享变体在严重组中而不是对照组中的突变，将鉴定由该基因编码的蛋白质，并分析其功能在各种蛋白质网络软件的框架中。将评估每个突变的频率，即所谓的次要等位基因频率，以突出显示正常种群中罕见的（MAF <0,01）的频率。
生物测量保留率：DNA样品
DNA样品已提取以用于整个外显子组测序
资格标准
| 符合研究资格的年龄： | 18年至70年（成人，老年人） |
| 有资格学习的男女： | 全部 |
| 接受健康的志愿者： | 是的 |
| 采样方法： | 非概率样本 |
研究人群
受共同10岁的患者：18-70（包括值）没有任何CO病态（分析我们医院的临床文件），没有任何定期治疗
标准
联系人和位置
联系人
| 联系人：医学博士Alain Calender | 0033 4 27 85 66 13 | alain.calender@chu-lyon.fr |
位置
| 法国 | |
| 里昂大学医院（Lyon Hospices Civils de Lyon） | 招募 |
| 法国里昂，69003 | |
赞助商和合作者
里昂的临终关怀
| 追踪信息 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 首先提交日期 | 2020年11月19日 | ||||
| 第一个发布日期 | 2020年11月25日 | ||||
| 最后更新发布日期 | 2020年11月25日 | ||||
| 估计研究开始日期 | 2020年12月1日 | ||||
| 估计初级完成日期 | 2021年6月1日（主要结果度量的最终数据收集日期） | ||||
| 当前的主要结果指标 | 数据评估的主要标准[时间范围：通过研究完成，平均6个月] 严重组中受致病变异影响影响的基因数量，并且在对照组中未观察到对对照组中的每个基因共享变体在严重组中而不是对照组中的突变，将鉴定由该基因编码的蛋白质，并分析其功能在各种蛋白质网络软件的框架中。将评估每个突变的频率，即所谓的次要等位基因频率，以突出显示正常种群中罕见的（MAF <0,01）的频率。 | ||||
| 原始主要结果指标 | 与电流相同 | ||||
| 改变历史 | 没有发布更改 | ||||
| 当前的次要结果指标 | 不提供 | ||||
| 原始的次要结果指标 | 不提供 | ||||
| 当前其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||
| 其他其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||
| 描述性信息 | |||||
| 简短标题 | 遗传易感性对严重形式的covid-19（SARS-COV2感染） | ||||
| 官方头衔 | 对无合并性患者的严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）的遗传倾向 | ||||
| 简要摘要 | 该项目的这一部分的主要目的是确定在正在进行的SARS-COV2（HCOVID-19）流行的背景下，鉴定SARS-COV2（COVID-19）感染的良性和严重形式的种系遗传因素。该项目的科学论证在附录中描述。我们假设在编码宿主病原体相互作用涉及的关键因素的基因中的病原变异可以解释某些患者对严重疾病的敏感性，即使在没有合并症的情况下也是如此。面临的挑战是确定可能是相关呼吸窘迫并可能进一步死亡的遗传因素。基于我们先前在结节病中的经验，一种多因素疾病易受机会性感染，我们将特别关注凋亡和自噬的调节，对病毒感染的免疫反应以及内质网应激反应（ER应激）（ER应激），这与凋亡密切相关。此类途径中的遗传缺陷可能会降低病毒颗粒的清除率，并诱导SARS-COV2和肺实质的破坏。我们的策略将与我们以前关于结节病的研究中所描述的相似，最近发表了。我们将通过整个外显子组测序（WES）结合了对SARS-COV2感染的良性和严重形式的基因型分析（WES），这是通过传染病专家定义的临床亚组和对基因分享致病变异板鉴定的功能网络的生物信息信息分析的作用。并区分严重的疾病形式。将仔细分析WES数据，并与所有细胞内生理过程以及涉及宿主 - 病原体相互作用的功能途径相关：细胞表面上的病毒靶标和下游信号，病毒基因组RNA复制以及新病毒颗粒的翻译，生产和释放。最后，我们的主要目标是基因面板的定义，与严重的感染形式更具体地相关，以及与SARS-COV2疾病贬值形式有关的有缺陷途径的表征，以识别推定的治疗靶标。 | ||||
| 详细说明 | 不提供 | ||||
| 研究类型 | 观察 | ||||
| 学习规划 | 观察模型：病例对照 时间视角：回顾 | ||||
| 目标随访时间 | 不提供 | ||||
| 生物测量 | 保留：DNA样品 描述： DNA样品已提取以用于整个外显子组测序 | ||||
| 采样方法 | 非概率样本 | ||||
| 研究人群 | 受共同10岁的患者：18-70（包括值）没有任何CO病态（分析我们医院的临床文件），没有任何定期治疗 | ||||
| 健康）状况 | 新冠肺炎 | ||||
| 干涉 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA | ||||
| 研究组/队列 |
| ||||
| 出版物 * | 不提供 | ||||
*包括数据提供商提供的出版物以及MEDLINE中临床标识符（NCT编号）确定的出版物。 | |||||
| 招聘信息 | |||||
| 招聘状况 | 招募 | ||||
| 估计入学人数 | 40 | ||||
| 原始估计注册 | 与电流相同 | ||||
| 估计学习完成日期 | 2021年12月1日 | ||||
| 估计初级完成日期 | 2021年6月1日（主要结果度量的最终数据收集日期） | ||||
| 资格标准 | 纳入标准：
排除标准： | ||||
| 性别/性别 |
| ||||
| 年龄 | 18年至70年（成人，老年人） | ||||
| 接受健康的志愿者 | 是的 | ||||
| 联系人 |
| ||||
| 列出的位置国家 | 法国 | ||||
| 删除了位置国家 | |||||
| 管理信息 | |||||
| NCT编号 | NCT04644146 | ||||
| 其他研究ID编号 | 69HCL20_1072 | ||||
| 有数据监测委员会 | 不提供 | ||||
| 美国FDA调节的产品 |
| ||||
| IPD共享声明 |
| ||||
| 责任方 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 研究赞助商 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 合作者 | 不提供 | ||||
| 调查人员 | 不提供 | ||||
| PRS帐户 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 验证日期 | 2020年11月 | ||||
研究描述
简要摘要：
该项目的这一部分的主要目的是确定在正在进行的SARS-COV2（HCOVID-19）流行的背景下，鉴定SARS-COV2（COVID-19）感染的良性和严重形式的种系遗传因素。该项目的科学论证在附录中描述。我们假设在编码宿主病原体相互作用涉及的关键因素的基因中的病原变异可以解释某些患者对严重疾病的敏感性，即使在没有合并症的情况下也是如此。面临的挑战是确定可能是相关呼吸窘迫并可能进一步死亡的遗传因素。基于我们先前在结节病中的经验，一种多因素疾病易受机会性感染，我们将特别关注凋亡和自噬的调节，对病毒感染的免疫反应以及内质网应激反应（ER应激）（ER应激），这与凋亡密切相关。此类途径中的遗传缺陷可能会降低病毒颗粒的清除率，并诱导SARS-COV2和肺实质的破坏。我们的策略将与我们以前关于结节病的研究中所描述的相似，最近发表了。我们将通过整个外显子组测序（WES）结合了对SARS-COV2感染的良性和严重形式的基因型分析（WES），这是通过传染病专家定义的临床亚组和对基因分享致病变异板鉴定的功能网络的生物信息信息分析的作用。并区分严重的疾病形式。将仔细分析WES数据，并与所有细胞内生理过程以及涉及宿主 - 病原体相互作用的功能途径相关：细胞表面上的病毒靶标和下游信号，病毒基因组RNA复制以及新病毒颗粒的翻译，生产和释放。最后，我们的主要目标是基因面板的定义，与严重的感染形式更具体地相关，以及与SARS-COV2疾病贬值形式有关的有缺陷途径的表征，以识别推定的治疗靶标。
| 病情或疾病 | 干预/治疗 |
|---|---|
| 新冠肺炎 | 遗传：遗传 |
学习规划
| 研究类型 ： | 观察 |
| 估计入学人数 ： | 40名参与者 |
| 观察模型： | 案例对照 |
| 时间观点： | 回顾 |
| 官方标题： | 对无合并性患者的严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）的遗传倾向 |
| 估计研究开始日期 ： | 2020年12月1日 |
| 估计初级完成日期 ： | 2021年6月1日 |
| 估计 学习完成日期 ： | 2021年12月1日 |
武器和干预措施
| 小组/队列 | 干预/治疗 |
|---|---|
| 严重 受SARS-COV2感染影响的患者需要氧气互补和重症监护支持 - 标准18-70岁，没有任何合并症 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA |
| 控制 受SARS-COV2影响的患者，如PCR和/或抗原测试诊断所示，没有任何或较小的临床表达 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA |
结果措施
主要结果指标 ：
- 数据评估的主要标准[时间范围：通过研究完成，平均6个月]严重组中受致病变异影响影响的基因数量，并且在对照组中未观察到对对照组中的每个基因共享变体在严重组中而不是对照组中的突变，将鉴定由该基因编码的蛋白质，并分析其功能在各种蛋白质网络软件的框架中。将评估每个突变的频率，即所谓的次要等位基因频率，以突出显示正常种群中罕见的（MAF <0,01）的频率。
生物测量保留率：DNA样品
DNA样品已提取以用于整个外显子组测序
资格标准
| 符合研究资格的年龄： | 18年至70年（成人，老年人） |
| 有资格学习的男女： | 全部 |
| 接受健康的志愿者： | 是的 |
| 采样方法： | 非概率样本 |
研究人群
受共同10岁的患者：18-70（包括值）没有任何CO病态（分析我们医院的临床文件），没有任何定期治疗
标准
联系人和位置
联系人
| 联系人：医学博士Alain Calender | 0033 4 27 85 66 13 | alain.calender@chu-lyon.fr |
位置
| 法国 | |
| 里昂大学医院（Lyon Hospices Civils de Lyon） | 招募 |
| 法国里昂，69003 | |
赞助商和合作者
里昂的临终关怀
| 追踪信息 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 首先提交日期 | 2020年11月19日 | ||||
| 第一个发布日期 | 2020年11月25日 | ||||
| 最后更新发布日期 | 2020年11月25日 | ||||
| 估计研究开始日期 | 2020年12月1日 | ||||
| 估计初级完成日期 | 2021年6月1日（主要结果度量的最终数据收集日期） | ||||
| 当前的主要结果指标 | 数据评估的主要标准[时间范围：通过研究完成，平均6个月] 严重组中受致病变异影响影响的基因数量，并且在对照组中未观察到对对照组中的每个基因共享变体在严重组中而不是对照组中的突变，将鉴定由该基因编码的蛋白质，并分析其功能在各种蛋白质网络软件的框架中。将评估每个突变的频率，即所谓的次要等位基因频率，以突出显示正常种群中罕见的（MAF <0,01）的频率。 | ||||
| 原始主要结果指标 | 与电流相同 | ||||
| 改变历史 | 没有发布更改 | ||||
| 当前的次要结果指标 | 不提供 | ||||
| 原始的次要结果指标 | 不提供 | ||||
| 当前其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||
| 其他其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||
| 描述性信息 | |||||
| 简短标题 | 遗传易感性对严重形式的covid-19（SARS-COV2感染） | ||||
| 官方头衔 | 对无合并性患者的严重形式的Covid-19（SARS-COV2感染）的遗传倾向 | ||||
| 简要摘要 | 该项目的这一部分的主要目的是确定在正在进行的SARS-COV2（HCOVID-19）流行的背景下，鉴定SARS-COV2（COVID-19）感染的良性和严重形式的种系遗传因素。该项目的科学论证在附录中描述。我们假设在编码宿主病原体相互作用涉及的关键因素的基因中的病原变异可以解释某些患者对严重疾病的敏感性，即使在没有合并症的情况下也是如此。面临的挑战是确定可能是相关呼吸窘迫并可能进一步死亡的遗传因素。基于我们先前在结节病中的经验，一种多因素疾病易受机会性感染，我们将特别关注凋亡和自噬的调节，对病毒感染的免疫反应以及内质网应激反应（ER应激）（ER应激），这与凋亡密切相关。此类途径中的遗传缺陷可能会降低病毒颗粒的清除率，并诱导SARS-COV2和肺实质的破坏。我们的策略将与我们以前关于结节病的研究中所描述的相似，最近发表了。我们将通过整个外显子组测序（WES）结合了对SARS-COV2感染的良性和严重形式的基因型分析（WES），这是通过传染病专家定义的临床亚组和对基因分享致病变异板鉴定的功能网络的生物信息信息分析的作用。并区分严重的疾病形式。将仔细分析WES数据，并与所有细胞内生理过程以及涉及宿主 - 病原体相互作用的功能途径相关：细胞表面上的病毒靶标和下游信号，病毒基因组RNA复制以及新病毒颗粒的翻译，生产和释放。最后，我们的主要目标是基因面板的定义，与严重的感染形式更具体地相关，以及与SARS-COV2疾病贬值形式有关的有缺陷途径的表征，以识别推定的治疗靶标。 | ||||
| 详细说明 | 不提供 | ||||
| 研究类型 | 观察 | ||||
| 学习规划 | 观察模型：病例对照 时间视角：回顾 | ||||
| 目标随访时间 | 不提供 | ||||
| 生物测量 | 保留：DNA样品 描述： DNA样品已提取以用于整个外显子组测序 | ||||
| 采样方法 | 非概率样本 | ||||
| 研究人群 | 受共同10岁的患者：18-70（包括值）没有任何CO病态（分析我们医院的临床文件），没有任何定期治疗 | ||||
| 健康）状况 | 新冠肺炎 | ||||
| 干涉 | 遗传：遗传 这是一项针对患者的回顾性研究，自从2020年3月的Covid-19-19- 19日大流行以来一直住院。已经收集了血液样本，这是对患者的定期随访的框架，并为大学医院正在进行的各种研究方案中提取并保守了DNA的框架。下一代测序将分析DNA | ||||
| 研究组/队列 |
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| 出版物 * | 不提供 | ||||
*包括数据提供商提供的出版物以及MEDLINE中临床标识符（NCT编号）确定的出版物。 | |||||
| 招聘信息 | |||||
| 招聘状况 | 招募 | ||||
| 估计入学人数 | 40 | ||||
| 原始估计注册 | 与电流相同 | ||||
| 估计学习完成日期 | 2021年12月1日 | ||||
| 估计初级完成日期 | 2021年6月1日（主要结果度量的最终数据收集日期） | ||||
| 资格标准 | 纳入标准：
排除标准： | ||||
| 性别/性别 |
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| 年龄 | 18年至70年（成人，老年人） | ||||
| 接受健康的志愿者 | 是的 | ||||
| 联系人 |
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| 列出的位置国家 | 法国 | ||||
| 删除了位置国家 | |||||
| 管理信息 | |||||
| NCT编号 | NCT04644146 | ||||
| 其他研究ID编号 | 69HCL20_1072 | ||||
| 有数据监测委员会 | 不提供 | ||||
| 美国FDA调节的产品 |
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| IPD共享声明 |
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| 责任方 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 研究赞助商 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 合作者 | 不提供 | ||||
| 调查人员 | 不提供 | ||||
| PRS帐户 | 里昂的临终关怀 | ||||
| 验证日期 | 2020年11月 | ||||
