• 鉴定与ID生物膜形成有关的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  鉴定涉及生物膜形成的病原体（ET，CVC，AC，UC）在重病肿瘤患者中。
• 比较生物膜相关的病原体与当前使用的生物样品中鉴定的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。
• 比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。 [时间范围：通过学习完成，平均1年]
  比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。
• 建立诊所生物学相关性[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  生物膜相关病原体与患者临床生物学数据之间的相关性：

  • 鼻，咽，直肠和皮肤病原体筛查；
  • 相关危险因素：中性粒细胞减少症，化学/放射疗法，皮质类固醇治疗，以前的抗感染疗法；
  • ID暴露时间；
  • 炎症的生物标记；
  • 诊断感染：呼吸道感染，尿路感染，血流感染，手术部位感染，起源未知的败血症等；
  • 严重程度得分：顺序[与败血症相关]器官衰竭评估（SOFA）评分，急性生理学和慢性健康评估II（Apache II）评分；
  • ICU和医院LO；
  • 患者的结果：生存/死亡；

• 从四个医疗设备的生物膜中鉴定出的病原体的比较[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  从同一患者收集的四个医用设备（内接管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）的生物膜中鉴定的病原体的比较。
• 比较生物膜中鉴定出的病原体与生物样品的标准培养物鉴定的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  比较生物膜中鉴定出的病原体与由生物样品（气管抽吸 /支气管肺泡灌洗，血液培养，尿液培养，皮肤分泌，受感染外科手术部位的拭子）鉴定的病原体的比较。
• 在肿瘤学重症患者中识别参与生物膜形成的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  在肿瘤学重症患者中鉴定了与生物膜形成的病原体（在气管导管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）中的鉴定。
• 建立临床生物学相关性[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  建立生物膜病原体鉴定的临床生物学相关性，

  • 医疗设备的插入期；
  • 炎症的生物标记；
  • 感染的临床诊断：呼吸道感染，手术部位感染，泌尿感染，阳性血液培养物感染，未指定起点的败血症；
  • 严重程度得分：沙发（顺序器官衰竭评估），Apache II（急性生理学和慢性健康评估）；
  • 重症监护的住院时间；
  • 结果：生存 /死亡；
  • 危险因素：中性粒细胞减少症，抗感染疗法，皮质类固醇使用，化学/放射治疗；

与使用留置医疗设备有关的医疗保健相关感染增加了医院的发病率，死亡率和重症监护治疗费用。减轻这些后果的基本策略是迅速的源识别和控制，并尽快使用适当的抗菌治疗开始。去除源是感染控制的黄金法则之一。对负责的细菌的早期鉴定是适当的反感染治疗的另一个主要指导因素。

尽管有多种检测/鉴定方法，但在临床实践中尚无明确的生物膜鉴定建议。黄金标准方法是细菌/真菌培养物，缺点与较晚的结果有关，尤其是对于缓慢的生长，挑剔的细菌或与不可培养菌株的存在有关的缺点。

为了获得更敏感，更具体的结果并增加了更好的生物膜表征的机会，在本研究中，研究人员比较了通过标准培养方法获得的生物膜鉴定结果与通过DNA扩增和下一代基因测序的生物膜鉴定结果。研究的生物膜与四个批评性疾病的肿瘤患者（内接管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）有关。

根据区域肿瘤学研究所的说法，IASI方案，所有需要侵入性通气支持（气管插管）的化粪池患者都将CVC，AC和UC作为护理标准插入了CVC，AC和UC。所有患者都均均接受了可疑败血症的管理方案：初始复苏，用于微生物学/分子生物学测试的标本收集，经验/靶向反感染治疗，源控制，源控制，多器官支持和对潜在疾病/合并症的治疗。在医院/ICU入院时，所有RIO患者均被筛查鼻，咽和直肠病原体定植。

知情同意 - 在ICU入院的最初24小时内，所有合格的患者将收到有关该研究的书面信息：其实施，目标，预期的优势和可能的风险，并将要求他们签署知情同意。如果由于病理或药物引起的意识急性改变，患者无法在ICU入院中同意，则法律代表可以授权。一旦参与者恢复了决策能力，将要求个人确认或撤回同意。

拭子采样 - 根据标准方法收集鼻，咽和直肠筛查拭子采样。除了此标准筛查外，还将在ICU入院的前24小时内，从注册患者的腹股沟区域进行皮肤样品，并使用无菌Copan Eswabtm Swabs获得建议的有氧，厌氧和挑剔的微生物剂。

生物膜采样和运输 - 当患者的临床状况决定它时，将进行四个ID（ET，CVC，AC，UC）的提取（可疑导管感染/由于改善或死亡而无需进一步需要）。这些设备只有在适应症和临床医生的医学判断中才会由医疗ICU人员提取，而不会受到患者的研究参与的影响。

生物膜的微生物处理和分析 - 微生物学分析将通过标准方法进行：标准培养基上的样品播种，然后根据CLSI标准标准和AST使用Microscan Walk Away40play®，Beckmann Coulter自动系统兼容Pannels，并根据CLSI标准和AST进行AST进行样品播种。 。

生物膜的分子生物学处理和分析 - 完整的样品收集后，将使用IlluminaMiseq®下一代测序仪系统进行可变区域V3 -V4 16S rRNA基因的基因测序。

• 肿瘤学
• 严重的疾病
• 败血症
• 医院感染

纳入标准：

1. 签署知情同意；
2. 年龄≥18岁；
3. 可疑/经过证明的败血症/化粪池休克（补充文件2）；
4. Apache II得分≥10（补充文件3）；
5. 可预测的侵入性通气支撑≥48小时；
6. 患者估计生存期≥4天。

排除标准：

1. 患者/法律代表拒绝；
2. 年龄<18岁；
3. 慢性精神病/神经疾病，决策能力受损；
4. 怀孕;
5. 侵入性通气支持<2天；
6. ICU入院后不到4天内死亡。

• 鉴定与ID生物膜形成有关的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  鉴定涉及生物膜形成的病原体（ET，CVC，AC，UC）在重病肿瘤患者中。
• 比较生物膜相关的病原体与当前使用的生物样品中鉴定的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。
• 比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。 [时间范围：通过学习完成，平均1年]
  比较生物膜相关的病原体与目前使用的生物样品（气管抽吸/支气管肺泡灌洗，血液培养，尿培养，手术伤口拭子等）中发现的病原体的比较。
• 建立诊所生物学相关性[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  生物膜相关病原体与患者临床生物学数据之间的相关性：

  • 鼻，咽，直肠和皮肤病原体筛查；
  • 相关危险因素：中性粒细胞减少症，化学/放射疗法，皮质类固醇治疗，以前的抗感染疗法；
  • ID暴露时间；
  • 炎症的生物标记；
  • 诊断感染：呼吸道感染，尿路感染，血流感染，手术部位感染，起源未知的败血症等；
  • 严重程度得分：顺序[与败血症相关]器官衰竭评估（SOFA）评分，急性生理学和慢性健康评估II（Apache II）评分；
  • ICU和医院LO；
  • 患者的结果：生存/死亡；

• 从四个医疗设备的生物膜中鉴定出的病原体的比较[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  从同一患者收集的四个医用设备（内接管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）的生物膜中鉴定的病原体的比较。
• 比较生物膜中鉴定出的病原体与生物样品的标准培养物鉴定的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  比较生物膜中鉴定出的病原体与由生物样品（气管抽吸 /支气管肺泡灌洗，血液培养，尿液培养，皮肤分泌，受感染外科手术部位的拭子）鉴定的病原体的比较。
• 在肿瘤学重症患者中识别参与生物膜形成的病原体[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  在肿瘤学重症患者中鉴定了与生物膜形成的病原体（在气管导管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）中的鉴定。
• 建立临床生物学相关性[时间范围：通过研究完成，平均1年]
  建立生物膜病原体鉴定的临床生物学相关性，

  • 医疗设备的插入期；
  • 炎症的生物标记；
  • 感染的临床诊断：呼吸道感染，手术部位感染，泌尿感染，阳性血液培养物感染，未指定起点的败血症；
  • 严重程度得分：沙发（顺序器官衰竭评估），Apache II（急性生理学和慢性健康评估）；
  • 重症监护的住院时间；
  • 结果：生存 /死亡；
  • 危险因素：中性粒细胞减少症，抗感染疗法，皮质类固醇使用，化学/放射治疗；

与使用留置医疗设备有关的医疗保健相关感染增加了医院的发病率，死亡率和重症监护治疗费用。减轻这些后果的基本策略是迅速的源识别和控制，并尽快使用适当的抗菌治疗开始。去除源是感染控制的黄金法则之一。对负责的细菌的早期鉴定是适当的反感染治疗的另一个主要指导因素。

尽管有多种检测/鉴定方法，但在临床实践中尚无明确的生物膜鉴定建议。黄金标准方法是细菌/真菌培养物，缺点与较晚的结果有关，尤其是对于缓慢的生长，挑剔的细菌或与不可培养菌株的存在有关的缺点。

为了获得更敏感，更具体的结果并增加了更好的生物膜表征的机会，在本研究中，研究人员比较了通过标准培养方法获得的生物膜鉴定结果与通过DNA扩增和下一代基因测序的生物膜鉴定结果。研究的生物膜与四个批评性疾病的肿瘤患者（内接管，中央静脉导管，动脉导管和尿导管）有关。

根据区域肿瘤学研究所的说法，IASI方案，所有需要侵入性通气支持（气管插管）的化粪池患者都将CVC，AC和UC作为护理标准插入了CVC，AC和UC。所有患者都均均接受了可疑败血症的管理方案：初始复苏，用于微生物学/分子生物学测试的标本收集，经验/靶向反感染治疗，源控制，源控制，多器官支持和对潜在疾病/合并症的治疗。在医院/ICU入院时，所有RIO患者均被筛查鼻，咽和直肠病原体定植。

知情同意 - 在ICU入院的最初24小时内，所有合格的患者将收到有关该研究的书面信息：其实施，目标，预期的优势和可能的风险，并将要求他们签署知情同意。如果由于病理或药物引起的意识急性改变，患者无法在ICU入院中同意，则法律代表可以授权。一旦参与者恢复了决策能力，将要求个人确认或撤回同意。

拭子采样 - 根据标准方法收集鼻，咽和直肠筛查拭子采样。除了此标准筛查外，还将在ICU入院的前24小时内，从注册患者的腹股沟区域进行皮肤样品，并使用无菌Copan Eswabtm Swabs获得建议的有氧，厌氧和挑剔的微生物剂。

生物膜采样和运输 - 当患者的临床状况决定它时，将进行四个ID（ET，CVC，AC，UC）的提取（可疑导管感染/由于改善或死亡而无需进一步需要）。这些设备只有在适应症和临床医生的医学判断中才会由医疗ICU人员提取，而不会受到患者的研究参与的影响。

生物膜的微生物处理和分析 - 微生物学分析将通过标准方法进行：标准培养基上的样品播种，然后根据CLSI标准标准和AST使用Microscan Walk Away40play®，Beckmann Coulter自动系统兼容Pannels，并根据CLSI标准和AST进行AST进行样品播种。 。

生物膜的分子生物学处理和分析 - 完整的样品收集后，将使用IlluminaMiseq®下一代测序仪系统进行可变区域V3 -V4 16S rRNA基因的基因测序。

• 肿瘤学
• 严重的疾病
• 败血症
• 医院感染

纳入标准：

1. 签署知情同意；
2. 年龄≥18岁；
3. 可疑/经过证明的败血症/化粪池休克（补充文件2）；
4. Apache II得分≥10（补充文件3）；
5. 可预测的侵入性通气支撑≥48小时；
6. 患者估计生存期≥4天。

排除标准：

1. 患者/法律代表拒绝；
2. 年龄<18岁；
3. 慢性精神病/神经疾病，决策能力受损；
4. 怀孕;
5. 侵入性通气支持<2天；
6. ICU入院后不到4天内死亡。