这是一项前瞻性研究，研究人员使用常规病理标本进行下一代测序（NGS），微卫星不稳定性（MSI）和免疫组织化学污渍。

病理检查包括PD-L1，EGFR状态，ALK和ROS-1。

NGS（下一代测序）：从EDTA-外外静脉血液中提取总DNA，并用QIAAMP®DNA血液迷你试剂盒和Qiaamp DNA FFPE组织试剂盒（Qiagen GMBH，Hilden，Hilden，Germany）与QIAAMP®DNA血液迷你试剂盒和Qiaamp®DNA血液迷你试剂盒中提取总DNA。对于DNA整个外显子组序列，简短，肿瘤和血液DNA由Covaris M220 Sonicator（欧洲生命技术，欧洲，绅士，比利时）进行超声处理，然后与适配器相连以进一步扩增（Illumina®Truseqexome expormose库库，美国）。所有图书馆的准备工作均在台北医科大学的癌症转化核心设施中进行。图书馆准备后，根据制造商的说明（美国圣地亚哥，Illumina），使用NextSeq500系统对所有样品进行测序。在测序性能之后，FASTQC评估了读取文件（FASTQ）的质量，然后使用人类HG19作为参考进行映射。 BAM文件被用作VARSCAN算法的输入，以识别种系和体细胞突变。使用IGV（Integrative Genomics查看器）手动检查注释和过滤的变体，然后通过Sanger序列确认。

为了计算每兆巴的TMB（总突变负担），计算的突变总数除以目标区域的编码区域的大小。

为了计算数学（突变 - 远产肿瘤异质性），研究者将首先获得每个肿瘤标本的MAF（DNA的比例）。 MAF分布将用于计算肿瘤中MAF的MD（分布中心）和MD（中位偏差）。 MD是通过从中位MAF中获得所有MAF的绝对差异来确定的。然后，绝对差异的中值乘以1.4826的因子来获得MD。数学值计算为MD与中位数的百分比比：MATH =（MD/中位数）×100。

MSI（微卫星不稳定性）微卫星不稳定性聚合酶链反应（MSI-PCR）MSI-PCR测试是由台北医科大学的癌症转化核心设施使用Promega MSI分析试剂盒（Promega）进行的。 MSI分析包括五个几乎单态单核苷酸标记（BAT-25，BAT-26，NR-21，NR-24和MONO-27），以进行MSI测定。根据制造商的指示（Promega）进行MSI分析。通过毛细管电泳分析产物，研究人员将5个单核苷酸基因座中的2个或以上的微卫星不稳定性解释为MSI-HIGH，是单个单核苷酸基因座的微卫星不稳定性为MSI-LOW，而在任何位于微片质stable的位置都没有不稳定性（ MSS）。

FDG PET的图像特征如下所述：

传统的图像参数包括原发性肿瘤的SUVMAX，代谢肿瘤体积（MTV）和总病变糖酵解（TLG）。传统的FDG PET参数是使用商业化软件（PBA，PMOD 4.0）计算的。放射素学（纹理分析）仅针对预处理FDG PET计算。放射线分析的矩阵包括直方图分析，灰度级共存在矩阵（GLCM），纹理特征编码编码共发生矩阵（TFCCM），灰度跑步矩阵（GLRLM） ），邻域灰色差矩阵（NGTDM），纹理特征编码矩阵（TFCM），纹理特征编码共发生矩阵（TFCCM）和相邻的灰度依赖矩阵矩阵（NGLD）。

• 癌症，肺
• 食道癌
• 头癌

纳入标准：

• 年龄至少20岁
• 病理经过验证的机火区癌症并接受了完整的分期检查
• 原发性肿瘤的病理标本
• 原发性肿瘤的固体部分对于肺或头颈癌至少应为2 cm。食管癌的原发性肿瘤至少应为CT2。

排除标准：

• 非清除术癌的共存。
• 诊断后仅获得最佳的支持护理。
• 无法遵守FDG PET/CT考试。
• 无法确定原发性肿瘤。

这是一项前瞻性研究，研究人员使用常规病理标本进行下一代测序（NGS），微卫星不稳定性（MSI）和免疫组织化学污渍。

病理检查包括PD-L1，EGFR状态，ALK和ROS-1。

NGS（下一代测序）：从EDTA-外外静脉血液中提取总DNA，并用QIAAMP®DNA血液迷你试剂盒和Qiaamp DNA FFPE组织试剂盒（Qiagen GMBH，Hilden，Hilden，Germany）与QIAAMP®DNA血液迷你试剂盒和Qiaamp®DNA血液迷你试剂盒中提取总DNA。对于DNA整个外显子组序列，简短，肿瘤和血液DNA由Covaris M220 Sonicator（欧洲生命技术，欧洲，绅士，比利时）进行超声处理，然后与适配器相连以进一步扩增（Illumina®Truseqexome expormose库库，美国）。所有图书馆的准备工作均在台北医科大学的癌症转化核心设施中进行。图书馆准备后，根据制造商的说明（美国圣地亚哥，Illumina），使用NextSeq500系统对所有样品进行测序。在测序性能之后，FASTQC评估了读取文件（FASTQ）的质量，然后使用人类HG19作为参考进行映射。 BAM文件被用作VARSCAN算法的输入，以识别种系和体细胞突变。使用IGV（Integrative Genomics查看器）手动检查注释和过滤的变体，然后通过Sanger序列确认。

为了计算每兆巴的TMB（总突变负担），计算的突变总数除以目标区域的编码区域的大小。

为了计算数学（突变 - 远产肿瘤异质性），研究者将首先获得每个肿瘤标本的MAF（DNA的比例）。 MAF分布将用于计算肿瘤中MAF的MD（分布中心）和MD（中位偏差）。 MD是通过从中位MAF中获得所有MAF的绝对差异来确定的。然后，绝对差异的中值乘以1.4826的因子来获得MD。数学值计算为MD与中位数的百分比比：MATH =（MD/中位数）×100。

MSI（微卫星不稳定性）微卫星不稳定性聚合酶链反应（MSI-PCR）MSI-PCR测试是由台北医科大学的癌症转化核心设施使用Promega MSI分析试剂盒（Promega）进行的。 MSI分析包括五个几乎单态单核苷酸标记（BAT-25，BAT-26，NR-21，NR-24和MONO-27），以进行MSI测定。根据制造商的指示（Promega）进行MSI分析。通过毛细管电泳分析产物，研究人员将5个单核苷酸基因座中的2个或以上的微卫星不稳定性解释为MSI-HIGH，是单个单核苷酸基因座的微卫星不稳定性为MSI-LOW，而在任何位于微片质stable的位置都没有不稳定性（ MSS）。

FDG PET的图像特征如下所述：

传统的图像参数包括原发性肿瘤的SUVMAX，代谢肿瘤体积（MTV）和总病变糖酵解（TLG）。传统的FDG PET参数是使用商业化软件（PBA，PMOD 4.0）计算的。放射素学（纹理分析）仅针对预处理FDG PET计算。放射线分析的矩阵包括直方图分析，灰度级共存在矩阵（GLCM），纹理特征编码编码共发生矩阵（TFCCM），灰度跑步矩阵（GLRLM） ），邻域灰色差矩阵（NGTDM），纹理特征编码矩阵（TFCM），纹理特征编码共发生矩阵（TFCCM）和相邻的灰度依赖矩阵矩阵（NGLD）。

• 癌症，肺
• 食道癌
• 头癌

纳入标准：

• 年龄至少20岁
• 病理经过验证的机火区癌症并接受了完整的分期检查
• 原发性肿瘤的病理标本
• 原发性肿瘤的固体部分对于肺或头颈癌至少应为2 cm。食管癌的原发性肿瘤至少应为CT2。

排除标准：

• 非清除术癌的共存。
• 诊断后仅获得最佳的支持护理。
• 无法遵守FDG PET/CT考试。
• 无法确定原发性肿瘤。