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出境医 / 临床实验 / 分析肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌(IMMDC)

分析肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌(IMMDC)

研究描述
简要摘要:

简介:大肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。传统的结肠镜检查作为一种侵入性检查方法不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。粪便免疫化学测试在敏感性方面存在一些局限性。同样,种族和区域差异可能会影响结果。肠道菌群组成的异常已被认为是结直肠癌的启动和进展的潜在重要病因。分析粪便菌群和去角质细胞基因可能代表了结直肠癌的新筛查工具。本研究的目的是使用16S rRNA比较大肠癌患者和健康对照组之间粪便菌群的差异。这些数据与粪便去角质细胞的DNA发现相结合,可以进一步阐明这种差异,以建立一个模型,以筛查中国人的早期结直肠癌

方法和分析:总共将招募300例阳性结肠镜检查结果和200个健康控制的患者。所有参与者将填写信息表和问卷。粪便样品将通过16S rRNA分析检查。在粪便去角质细胞中将检测到基因甲基化水平。将建立相关肠道菌群和甲基化基因的模型。接收器操作特性(ROC)曲线分析将用于选择具有适当敏感性和特异性的某些模型。该模型将通过多中心鞋类进一步验证。


病情或疾病 干预/治疗
胃肠道微生物组DNA甲基化结直肠肿瘤其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

展示显示详细说明
学习规划
研究信息的布局表
研究类型观察
估计入学人数 500名参与者
观察模型:病例对照
时间观点:回顾
官方标题:肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌的分析:结直肠肿瘤筛查的研究方案
实际学习开始日期 2018年2月1日
估计的初级完成日期 2020年12月1日
估计 学习完成日期 2021年12月1日
武器和干预措施
组/队列 干预/治疗
控制组
健康对照必须年满18-75岁,没有肿瘤,也没有癌症史。
其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

测试组
实验组的纳入标准为18-75岁,结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤,活检确认的腺癌或腺瘤,没有化学疗法或手术,也没有其他癌症史。两组都必须能够理解并愿意签署知情同意。
其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

结果措施
主要结果指标
  1. 大肠癌模型在中国人中的诊断功效[时间范围:2年]
    CRC患者和健康个体之间肠道菌群和基因甲基化的差异。


次要结果度量
  1. 饮食对中国人中肠道菌群和DNA甲基化的影响[时间范围:3年]
    研究频率(例如,“每周多少次”),数量(例如,“ G”)和半定量食品频率问卷(SQFFQ)的食物类型


其他结果措施:
  1. 胆囊切除术对肠道菌群和甲基化的影响[时间范围:3年]
    所有参与者都填写了一个信息表格,以收集有关年龄,性别,职业等的数据。同时,我们还将收集胆囊切除术的病史和时间。

  2. 肠道菌群和DNA甲基化在不同的粪便特征下的影响[时间范围:3年至4年]
    使用Bristol凳子量表方法对粪便进行分类。分数从1到7分,得分较低表示粪便更硬。


生物测量保留率:DNA样品
在结肠镜检查之前,从参与者那里收集粪便样品。要求参与者在标准化容器中收集粪便样品,然后立即将其存储在-80ºC。

资格标准
有资格信息的布局表
有资格学习的年龄: 18年至75岁(成人,老年人)
有资格学习的男女:全部
采样方法:非概率样本
研究人群

该计划是在中国湖南州长沙(Changsha)的Xiangya医院(仍在招募)进行的。

只有接受结肠镜检查的参与者才被注册

标准

纳入标准:

  • 结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤以及活检确认的腺癌或腺瘤。
  • 没有化​​学疗法或手术,也没有其他癌症的史。
  • 必须能够理解并愿意签署知情同意。
  • 健康对照没有肿瘤和癌症病史。

排除标准:

  • 那些不愿意在研究开始之前提供标本或回答问卷的人。
  • 粪便样品不符合要求的人。
  • 不愿签署书面知情同意书或遵守研究方案的人。
联系人和位置

联系人
位置联系人的布局表
联系人:Weidong Liu,博士86-13873124855 weidong.liu@csu.edu.cn
联系人:Mingmei Liao,博士86-15388023797 mingmeiliao@csu.edu.cn

位置
布局表以获取位置信息
中国,湖南
中央南大学的木安医院招募
长沙,中国湖南,410000
联系人:Liu Wei Dong,0086-13873124855 Davidcsu@foxmail.com
首席研究员:Mingmei Liao,博士
首席研究员:XI Xie,博士
首席调查员:Jie Chen
首席研究员:Zhan Qu
赞助商和合作者
魏登·刘,医学博士
湖南省自然科学基金会
调查人员
调查员信息的布局表
学习主席: Weidong Liu,博士中央南大学的木安医院
研究主任: Mingmei Liao,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: XI Xie,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Jie Chen,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Zhan QU,博士中央南大学的木安医院
追踪信息
首先提交日期2019年11月5日
第一个发布日期2020年3月10日
上次更新发布日期2020年3月10日
实际学习开始日期2018年2月1日
估计的初级完成日期2020年12月1日(主要结果指标的最终数据收集日期)
当前的主要结果指标
(提交:2020年3月6日)
大肠癌模型在中国人中的诊断功效[时间范围:2年]
CRC患者和健康个体之间肠道菌群和基因甲基化的差异。
原始主要结果指标与电流相同
改变历史没有发布更改
当前的次要结果指标
(提交:2020年3月6日)
饮食对中国人中肠道菌群和DNA甲基化的影响[时间范围:3年]
研究频率(例如,“每周多少次”),数量(例如,“ G”)和半定量食品频率问卷(SQFFQ)的食物类型
原始的次要结果指标与电流相同
当前其他预先指定的结果指标
(提交:2020年3月6日)
  • 胆囊切除术对肠道菌群和甲基化的影响[时间范围:3年]
    所有参与者都填写了一个信息表格,以收集有关年龄,性别,职业等的数据。同时,我们还将收集胆囊切除术的病史和时间。
  • 肠道菌群和DNA甲基化在不同的粪便特征下的影响[时间范围:3年至4年]
    使用Bristol凳子量表方法对粪便进行分类。分数从1到7分,得分较低表示粪便更硬。
原始其他预先指定的结果指标与电流相同
描述性信息
简短标题肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合分析以检测结直肠癌
官方头衔肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌的分析:结直肠肿瘤筛查的研究方案
简要摘要

简介:大肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。传统的结肠镜检查作为一种侵入性检查方法不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。粪便免疫化学测试在敏感性方面存在一些局限性。同样,种族和区域差异可能会影响结果。肠道菌群组成的异常已被认为是结直肠癌的启动和进展的潜在重要病因。分析粪便菌群和去角质细胞基因可能代表了结直肠癌的新筛查工具。本研究的目的是使用16S rRNA比较大肠癌患者和健康对照组之间粪便菌群的差异。这些数据与粪便去角质细胞的DNA发现相结合,可以进一步阐明这种差异,以建立一个模型,以筛查中国人的早期结直肠癌

方法和分析:总共将招募300例阳性结肠镜检查结果和200个健康控制的患者。所有参与者将填写信息表和问卷。粪便样品将通过16S rRNA分析检查。在粪便去角质细胞中将检测到基因甲基化水平。将建立相关肠道菌群和甲基化基因的模型。接收器操作特性(ROC)曲线分析将用于选择具有适当敏感性和特异性的某些模型。该模型将通过多中心鞋类进一步验证。

详细说明

简介:结直肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。在中国,CRC是癌症死亡的第五个主要原因。 CRC年龄标准化的发病率显示出向上的趋势。一种西化的生活方式,尤其是身体上的不活跃,近几十年来中国肥胖症患病率的提高可能会解释CRC发病率的增加。

CRC患者的5年生存率为65%。 CRC的存活率可能取决于各种因素,尤其是癌症阶段。局部CRC的5年生存率为90%。在此早期,约有39%的患者被诊断出。由于缺乏典型的临床症状,早期CRC很难检测到,并且大多数患者在诊断出CRC时已经处于晚期阶段,因此缺少最佳干预阶段。因此,早期检测和早期治疗是降低CRC死亡率的有效手段。筛查具有好处,包括在较早阶段的诊断,降低了CRC的发生率和降低的死亡率。

目前,CRC的主要筛查方法是粪便血液检查和结肠镜检查。结肠镜检查是筛选CRC的金标准。然而,传统的结肠镜检查是一种侵入性检查方法,不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。

粪便样品很容易获得。筛查CRC是当前的研究共识。根据CRC筛查最新更新的亚太共识建议,FIT(粪便免疫化学测试)用于选择高危患者进行结肠镜检查。 FIT在其他世界地区也广泛使用。拟合的敏感性受到限制(0.79; 95%CI,0.69-0.86),并且最近的系统荟萃分析在研究之间的敏感性差异很大。此外,种族和区域差异可能会影响测试结果。因此,需要的早期筛查方法是无创,高度敏感且适合中国人的。

在当前临床环境中检测血液/等离子体生物标志物的粪便中分子生物标志物的检测可能是检测血液/等离子体生物标志物的有希望的替代方法。肠道菌群组成的异常已被认为是CRC的潜在重要原因。随着在肠道菌群研究中广泛使用元基因组测序和焦磷酸测序,发现更多的细菌与CRC发病率呈正相关。在最近的一项研究中,使用16S rRNA测序在结直肠肿瘤发生的不同阶段对人肠粘膜中的微生物群落进行分类,发现哥杆菌富集在结直肠肿瘤中。

对于CRC而言,良性息肉成为恶性肿瘤的主要过程是遗传和表观遗传学改变的积累,这些改变将结肠上皮细胞转化为结肠腺癌细胞。这些细胞连续脱落成结肠管腔,并与凳子混合。在肿瘤形成期间,表观遗传变化可能比突变更早。表观遗传机制的放松管制在癌症中起重要作用。癌症的大多数表观遗传变化是由特定基因的基因组改变引起的,这些基因与控制一种表观遗传机制有关。肿瘤抑制基因的含量DNA甲基化抑制了下游基因的异常表达,这是肿瘤发生过程中的重要步骤。 CRC进展过程中DNA变化的甲基化状态。在最近的研究中发现的许多与CRC相关的基因甲基化异常包括SFRP2,SEPT9,BMP3,NDRG4和SPG20。另外,某些基因突变与CRC有关。例如,TP53和KRAS突变在CRC中很常见。

在先前的研究中,研究者发现SEPT9,NDRG4和SDC2的肿瘤频率和甲基化水平高于正常或非肿瘤相邻CRC组织,表明这些甲基化基因可能具有CRC筛查的诊断潜力。但是,BMP3对粪便样品的检测准确性的贡献非常有限。此外,甲基化的SEPT9,NDRG4和SDC2的组合表现出高可见的CRC和腺瘤的可行性,并且进一步的研究表明,检测CRC的性能比腺瘤更好。我们的研究还表明,不同种族之间的粪便基因差异。

这项研究旨在通过CRC患者和健康对照组之间的16S rRNA分析来检测粪便中的肠道菌群差异。它将结合粪便去角质细胞的DNA分析,以进一步阐明这种差异,以构建一些模型,以筛选中国人的早期结直肠癌。同时,该研究还将研究中国饮食习惯对肠道菌群的影响。

研究类型观察
学习规划观察模型:病例对照
时间观点:回顾
目标随访时间不提供
生物测量保留:DNA样品
描述:
在结肠镜检查之前,从参与者那里收集粪便样品。要求参与者在标准化容器中收集粪便样品,然后立即将其存储在-80ºC。
采样方法非概率样本
研究人群

该计划是在中国湖南州长沙(Changsha)的Xiangya医院(仍在招募)进行的。

只有接受结肠镜检查的参与者才被注册

健康)状况
  • 胃肠道微生物组
  • DNA甲基化
  • 结直肠肿瘤
干涉其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
研究组/队列
  • 控制组
    健康对照必须年满18-75岁,没有肿瘤,也没有癌症史。
    干预:其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
  • 测试组
    实验组的纳入标准为18-75岁,结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤,活检确认的腺癌或腺瘤,没有化学疗法或手术,也没有其他癌症史。两组都必须能够理解并愿意签署知情同意。
    干预:其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
出版物 *
  • Brenner H,Kloor M,Pox CP。结直肠癌。柳叶刀。 2014年4月26日; 383(9927):1490-1502。 doi:10.1016/s0140-6736(13)61649-9。 EPUB 2013 11月11日。评论。
  • Chen W,Zheng R,Baade PD,Zhang S,Zeng H,Bray F,Jemal A,Yu XQ,He J.中国的癌症统计,2015年。CACancer J Clin。 2016 Mar-Apr; 66(2):115-32。 doi:10.3322/caac.21338。 Epub 2016年1月25日。
  • Varghese C,Shin Hr。加强中国的癌症控制。柳叶刀Oncol。 2014年4月; 15(5):484-5。 doi:10.1016/s1470-2045(14)70056-7。
  • Wang YX,Zhu N,Zhang CJ,Wang YK,Wu HT,Li Q,Du K,Liao DF,Qin L.朋友或敌人:脂肪组织在癌症形成和进展中的多种作用。 J细胞生理学。 2019年12月; 234(12):21436-21449。 doi:10.1002/jcp.28776。 Epub 2019 5月3日。审查。
  • Siegel RL,Miller KD,Fedewa SA,Ahnen DJ,Meester RGS,Barzi A,Jemal A.结直肠癌统计,2017年。CACancer J Clin。 2017年5月6日; 67(3):177-193。 doi:10.3322/caac.21395。 Epub 2017 3月1日。
  • Hewitson P,Glasziou P,Watson E,Towler B,Irwig L.使用粪便隐匿血液测试(Hemocult)对结直肠癌筛查的Cochrane系统评价:更新。 Am J Gastroenterol。 2008 Jun; 103(6):1541-9。 doi:10.1111/j.1572-0241.2008.01875.x。 Epub 2008年5月13日。
  • Sung JJ,Lau JY,Young GP,Sano Y,Chiu HM,Byeon JS,Yeoh KG,Goh KL,Sollano J,Sollano J,Rerknimitr R,Matsuda T,Wu KC,NG S,NG S,Leung S,Leung Sy,Makharia G,Makharia G,Chong VH,Chong VH,Ho Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky Ky ,Brooks D,Lieberman DA,Chan FK;亚太结直肠癌的工作组。亚太大肠癌筛查的共识建议。肠。 2008年8月; 57(8):1166-76。 doi:10.1136/gut.2007.146316。
  • Lee JK,Liles EG,Bent S,Levin TR,Corley DA。结直肠癌的粪便免疫化学测试的准确性:系统评价和荟萃分析。 Ann Intern Med。 2014年2月4日; 160(3):171。 doi:10.7326/m13-1484。审查。
  • Liang Q,Chiu J,Chen Y,Huang Y,Higashimori A,Fang J,Brim H,Ashktorab H,Ng SC,Ng SSM,Zheng S,Chan FKL,Sung Jjy,Yu J.结直肠癌的诊断。 Clin Cancer Res。 2017年4月15日; 23(8):2061-2070。 doi:10.1158/1078-0432.CCR-16-1599。 Epub 2016年10月3日。
  • Carmona FJ,Azuara D,Berenguer-llergo A,FernándezAF,Biondo S,De Oca J,Rodriguez-Moranta F,Salazar R,Salazar R,Villanueva A,Villanueva A,Villaiola MF,Gravera J,CapelláG,CapelláG,Esteller M,Moreno V.DNA甲基化生物甲基化生物甲基化生物甲基化生物包括用于无创诊断结直肠癌。癌症预科(Phila)。 2013年7月; 6(7):656-65。 doi:10.1158/1940-6207.CAPR-12-0501。 Epub 2013年5月21日。
  • Maleszewska M,Wojtas B,KamińskaB。癌症表观遗传机制的放松管制。后epy Biochem。 2018年10月15日; 64(2):148-156。 doi:10.18388/pb.2018_125。审查。
  • Park SK,Baek HL,Yu J,Kim JY,Yang HJ,Jung YS,Choi KY,Kim H,Kim Ho,Jeong Ku,Chun HK,Kim K,Kim K,Park DI。 SFRP2,TFPI2,NDRG4和BMP3启动子的甲基化分析是否适用于韩国人口中的大肠癌筛查? Intest Res。 2017年10月; 15(4):495-501。 doi:10.5217/ir.2017.15.4.495。 Epub 2017年10月23日。
  • Devos T,Tetzner R,Model F,Weiss G,Schuster M,Distler J,Steiger KV,GrützmannR,Pilarsky C,Habermann JK,Fleshner PR,Fleshner PR,Oubre BM,Day R,Sledziewski AZ,Sledziewski AZ,Lofton-Day-Day-Day-Day C.循环甲基化的SEPT9 SEST9血浆中的DNA是结直肠癌的生物标志物。 Clin Chem。 2009年7月; 55(7):1337-46。 doi:10.1373/clinchem.2008.115808。 Epub 2009年4月30日。
  • Melotte V, Lentjes MH, van den Bosch SM, Hellebrekers DM, de Hoon JP, Wouters KA, Daenen KL, Partouns-Hendriks IE, Stessels F, Louwagie J, Smits KM, Weijenberg MP, Sanduleanu S, Khalid-de Bakker CA, Oort FA,Meijer GA,Jonkers DM,Herman JG,DeBruïneAP,Van Engeland M. N-Myc下游调节的基因4(NDRG4):候选肿瘤抑制基因和结直肠癌的潜在生物标志物。 J NATL癌症研究所。 2009年7月1日; 101(13):916-27。 doi:10.1093/jnci/djp131。 Epub 2009年6月17日。
  • Okada S,Hata K,Kawai K,Yamamoto Y,Tanaka T,Nishikawa T,Sasaki K,Kaneko M,Emoto S,Murono K,Nozawa H. Kras G13D突变与吻合性复发之间的关联,结论性癌症:两例报告。医学(巴尔的摩)。 2019年3月; 98(12):E14781。 doi:10.1097/MD.0000000000014781。
  • Zeng N,Xiang J.通过锚固型DNA电化学生物传感器检测KRAS G12D点突变水平。塔兰塔。 2019年6月1日; 198:111-117。 doi:10.1016/j.talanta.2019.01.105。 Epub 2019 1月31日。
  • Chen J,Sun H,Tang W,Zhou L,Xie X,Qu Z,Chen M,王粪便中的生物标志物用于早期筛查结直肠癌。 J癌。 2019年8月28日; 10(21):5264-5271。 doi:10.7150/jca.34944。 2019年环保。
  • Rasmussen L, Wilhelmsen M, Christensen IJ, Andersen J, Jørgensen LN, Rasmussen M, Hendel JW, Madsen MR, Vilandt J, Hillig T, Klærke M, Münster AM, Andersen LM, Andersen B, Hornung N, Erlandsen EJ, Khalid A ,尼尔森HJ。方案概述了前瞻性内窥镜研究研究的第1部分和第2部分,用于早期检测结直肠癌:基于血液生物标志物的概念的验证。 Jmir res Protoc。 2016年9月13日; 5(3):E182。 doi:10.2196/resprot.6346。
  • Liu S,Wen L,Hou J,Nie S,Zhou J,Cao F,Lu Q,Qin Y,Fu Y,Yu X.使用基于Intravoxel Inconerent Inconerent Inconerent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent Incorherent themohatent themohatight运动扩散加权成像。腹部放射线(纽约)。 2019年8月; 44(8):2689-2698。 doi:10.1007/s00261-019-02032-0。

*包括由数据提供商提供的出版物以及Medline中临床标识符(NCT编号)的出版物。
招聘信息
招聘状况招募
估计入学人数
(提交:2020年3月6日)
500
原始估计注册与电流相同
估计学习完成日期2021年12月1日
估计的初级完成日期2020年12月1日(主要结果指标的最终数据收集日期)
资格标准

纳入标准:

  • 结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤以及活检确认的腺癌或腺瘤。
  • 没有化​​学疗法或手术,也没有其他癌症的史。
  • 必须能够理解并愿意签署知情同意。
  • 健康对照没有肿瘤和癌症病史。

排除标准:

  • 那些不愿意在研究开始之前提供标本或回答问卷的人。
  • 粪便样品不符合要求的人。
  • 不愿签署书面知情同意书或遵守研究方案的人。
性别/性别
有资格学习的男女:全部
年龄18年至75岁(成人,老年人)
接受健康的志愿者不提供
联系人
联系人:Weidong Liu,博士86-13873124855 weidong.liu@csu.edu.cn
联系人:Mingmei Liao,博士86-15388023797 mingmeiliao@csu.edu.cn
列出的位置国家中国
删除了位置国家
管理信息
NCT编号NCT04302363
其他研究ID编号CCRS-2
有数据监测委员会是的
美国FDA调节的产品
研究美国FDA调节的药物:
研究美国FDA调节的设备产品:
IPD共享声明
计划共享IPD:不确定
计划描述:数据共享不适用于本文,因为在当前研究期间未生成或分析数据集。数据将以数字形式保存在Excel形式中,图像将以PNG格式保存。所有数据将保存由WEI教授保存。 - 刘。
责任方中央南大学西安加利亚医院医学博士Weidong Liu
研究赞助商魏登·刘,医学博士
合作者湖南省自然科学基金会
调查人员
学习主席: Weidong Liu,博士中央南大学的木安医院
研究主任: Mingmei Liao,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: XI Xie,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Jie Chen,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Zhan QU,博士中央南大学的木安医院
PRS帐户中央南大学的木安医院
验证日期2020年3月
研究描述
简要摘要:

简介:大肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。传统的结肠镜检查作为一种侵入性检查方法不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。粪便免疫化学测试在敏感性方面存在一些局限性。同样,种族和区域差异可能会影响结果。肠道菌群组成的异常已被认为是结直肠癌的启动和进展的潜在重要病因。分析粪便菌群和去角质细胞基因可能代表了结直肠癌的新筛查工具。本研究的目的是使用16S rRNA比较大肠癌患者和健康对照组之间粪便菌群的差异。这些数据与粪便去角质细胞的DNA发现相结合,可以进一步阐明这种差异,以建立一个模型,以筛查中国人的早期结直肠癌

方法和分析:总共将招募300例阳性结肠镜检查结果和200个健康控制的患者。所有参与者将填写信息表和问卷。粪便样品将通过16S rRNA分析检查。在粪便去角质细胞中将检测到基因甲基化水平。将建立相关肠道菌群和甲基化基因的模型。接收器操作特性(ROC)曲线分析将用于选择具有适当敏感性和特异性的某些模型。该模型将通过多中心鞋类进一步验证。


病情或疾病 干预/治疗
胃肠道微生物组DNA甲基化结直肠肿瘤其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

展示显示详细说明
学习规划
研究信息的布局表
研究类型观察
估计入学人数 500名参与者
观察模型:病例对照
时间观点:回顾
官方标题:肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌的分析:结直肠肿瘤筛查的研究方案
实际学习开始日期 2018年2月1日
估计的初级完成日期 2020年12月1日
估计 学习完成日期 2021年12月1日
武器和干预措施
组/队列 干预/治疗
控制组
健康对照必须年满18-75岁,没有肿瘤,也没有癌症史。
其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

测试组
实验组的纳入标准为18-75岁,结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤,活检确认的腺癌或腺瘤,没有化学疗法或手术,也没有其他癌症史。两组都必须能够理解并愿意签署知情同意。
其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测

结果措施
主要结果指标
  1. 大肠癌模型在中国人中的诊断功效[时间范围:2年]
    CRC患者和健康个体之间肠道菌群和基因甲基化的差异。


次要结果度量
  1. 饮食对中国人中肠道菌群和DNA甲基化的影响[时间范围:3年]
    研究频率(例如,“每周多少次”),数量(例如,“ G”)和半定量食品频率问卷(SQFFQ)的食物类型


其他结果措施:
  1. 胆囊切除术对肠道菌群和甲基化的影响[时间范围:3年]
    所有参与者都填写了一个信息表格,以收集有关年龄,性别,职业等的数据。同时,我们还将收集胆囊切除术的病史和时间。

  2. 肠道菌群和DNA甲基化在不同的粪便特征下的影响[时间范围:3年至4年]
    使用Bristol凳子量表方法对粪便进行分类。分数从1到7分,得分较低表示粪便更硬。


生物测量保留率:DNA样品
在结肠镜检查之前,从参与者那里收集粪便样品。要求参与者在标准化容器中收集粪便样品,然后立即将其存储在-80ºC。

资格标准
有资格信息的布局表
有资格学习的年龄: 18年至75岁(成人,老年人)
有资格学习的男女:全部
采样方法:非概率样本
研究人群

该计划是在中国湖南州长沙(Changsha)的Xiangya医院(仍在招募)进行的。

只有接受结肠镜检查的参与者才被注册

标准

纳入标准:

  • 结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤以及活检确认的腺癌或腺瘤。
  • 没有化​​学疗法或手术,也没有其他癌症的史。
  • 必须能够理解并愿意签署知情同意。
  • 健康对照没有肿瘤和癌症病史。

排除标准:

  • 那些不愿意在研究开始之前提供标本或回答问卷的人。
  • 粪便样品不符合要求的人。
  • 不愿签署书面知情同意书或遵守研究方案的人。
联系人和位置

联系人
位置联系人的布局表
联系人:Weidong Liu,博士86-13873124855 weidong.liu@csu.edu.cn
联系人:Mingmei Liao,博士86-15388023797 mingmeiliao@csu.edu.cn

位置
布局表以获取位置信息
中国,湖南
中央南大学的木安医院招募
长沙,中国湖南,410000
联系人:Liu Wei Dong,0086-13873124855 Davidcsu@foxmail.com
首席研究员:Mingmei Liao,博士
首席研究员:XI Xie,博士
首席调查员:Jie Chen
首席研究员:Zhan Qu
赞助商和合作者
魏登·刘,医学博士
湖南省自然科学基金会
调查人员
调查员信息的布局表
学习主席: Weidong Liu,博士中央南大学的木安医院
研究主任: Mingmei Liao,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: XI Xie,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Jie Chen,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Zhan QU,博士中央南大学的木安医院
追踪信息
首先提交日期2019年11月5日
第一个发布日期2020年3月10日
上次更新发布日期2020年3月10日
实际学习开始日期2018年2月1日
估计的初级完成日期2020年12月1日(主要结果指标的最终数据收集日期)
当前的主要结果指标
(提交:2020年3月6日)
大肠癌模型在中国人中的诊断功效[时间范围:2年]
CRC患者和健康个体之间肠道菌群和基因甲基化的差异。
原始主要结果指标与电流相同
改变历史没有发布更改
当前的次要结果指标
(提交:2020年3月6日)
饮食对中国人中肠道菌群和DNA甲基化的影响[时间范围:3年]
研究频率(例如,“每周多少次”),数量(例如,“ G”)和半定量食品频率问卷(SQFFQ)的食物类型
原始的次要结果指标与电流相同
当前其他预先指定的结果指标
(提交:2020年3月6日)
  • 胆囊切除术对肠道菌群和甲基化的影响[时间范围:3年]
    所有参与者都填写了一个信息表格,以收集有关年龄,性别,职业等的数据。同时,我们还将收集胆囊切除术的病史和时间。
  • 肠道菌群和DNA甲基化在不同的粪便特征下的影响[时间范围:3年至4年]
    使用Bristol凳子量表方法对粪便进行分类。分数从1到7分,得分较低表示粪便更硬。
原始其他预先指定的结果指标与电流相同
描述性信息
简短标题肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合分析以检测结直肠癌
官方头衔肠道菌群与粪便中的DNA甲基化结合以检测结直肠癌的分析:结直肠肿瘤筛查的研究方案
简要摘要

简介:大肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。传统的结肠镜检查作为一种侵入性检查方法不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。粪便免疫化学测试在敏感性方面存在一些局限性。同样,种族和区域差异可能会影响结果。肠道菌群组成的异常已被认为是结直肠癌的启动和进展的潜在重要病因。分析粪便菌群和去角质细胞基因可能代表了结直肠癌的新筛查工具。本研究的目的是使用16S rRNA比较大肠癌患者和健康对照组之间粪便菌群的差异。这些数据与粪便去角质细胞的DNA发现相结合,可以进一步阐明这种差异,以建立一个模型,以筛查中国人的早期结直肠癌

方法和分析:总共将招募300例阳性结肠镜检查结果和200个健康控制的患者。所有参与者将填写信息表和问卷。粪便样品将通过16S rRNA分析检查。在粪便去角质细胞中将检测到基因甲基化水平。将建立相关肠道菌群和甲基化基因的模型。接收器操作特性(ROC)曲线分析将用于选择具有适当敏感性和特异性的某些模型。该模型将通过多中心鞋类进一步验证。

详细说明

简介:结直肠癌(CRC)的发病率最高和第四死亡率。在中国,CRC是癌症死亡的第五个主要原因。 CRC年龄标准化的发病率显示出向上的趋势。一种西化的生活方式,尤其是身体上的不活跃,近几十年来中国肥胖症' target='_blank'>肥胖症患病率的提高可能会解释CRC发病率的增加。

CRC患者的5年生存率为65%。 CRC的存活率可能取决于各种因素,尤其是癌症阶段。局部CRC的5年生存率为90%。在此早期,约有39%的患者被诊断出。由于缺乏典型的临床症状,早期CRC很难检测到,并且大多数患者在诊断出CRC时已经处于晚期阶段,因此缺少最佳干预阶段。因此,早期检测和早期治疗是降低CRC死亡率的有效手段。筛查具有好处,包括在较早阶段的诊断,降低了CRC的发生率和降低的死亡率。

目前,CRC的主要筛查方法是粪便血液检查和结肠镜检查。结肠镜检查是筛选CRC的金标准。然而,传统的结肠镜检查是一种侵入性检查方法,不能广泛用于筛查结直肠肿瘤。

粪便样品很容易获得。筛查CRC是当前的研究共识。根据CRC筛查最新更新的亚太共识建议,FIT(粪便免疫化学测试)用于选择高危患者进行结肠镜检查。 FIT在其他世界地区也广泛使用。拟合的敏感性受到限制(0.79; 95%CI,0.69-0.86),并且最近的系统荟萃分析在研究之间的敏感性差异很大。此外,种族和区域差异可能会影响测试结果。因此,需要的早期筛查方法是无创,高度敏感且适合中国人的。

在当前临床环境中检测血液/等离子体生物标志物的粪便中分子生物标志物的检测可能是检测血液/等离子体生物标志物的有希望的替代方法。肠道菌群组成的异常已被认为是CRC的潜在重要原因。随着在肠道菌群研究中广泛使用元基因组测序和焦磷酸测序,发现更多的细菌与CRC发病率呈正相关。在最近的一项研究中,使用16S rRNA测序在结直肠肿瘤发生的不同阶段对人肠粘膜中的微生物群落进行分类,发现哥杆菌富集在结直肠肿瘤中。

对于CRC而言,良性息肉成为恶性肿瘤的主要过程是遗传和表观遗传学改变的积累,这些改变将结肠上皮细胞转化为结肠腺癌细胞。这些细胞连续脱落成结肠管腔,并与凳子混合。在肿瘤形成期间,表观遗传变化可能比突变更早。表观遗传机制的放松管制在癌症中起重要作用。癌症的大多数表观遗传变化是由特定基因的基因组改变引起的,这些基因与控制一种表观遗传机制有关。肿瘤抑制基因的含量DNA甲基化抑制了下游基因的异常表达,这是肿瘤发生过程中的重要步骤。 CRC进展过程中DNA变化的甲基化状态。在最近的研究中发现的许多与CRC相关的基因甲基化异常包括SFRP2,SEPT9,BMP3,NDRG4和SPG20。另外,某些基因突变与CRC有关。例如,TP53和KRAS突变在CRC中很常见。

在先前的研究中,研究者发现SEPT9,NDRG4和SDC2的肿瘤频率和甲基化水平高于正常或非肿瘤相邻CRC组织,表明这些甲基化基因可能具有CRC筛查的诊断潜力。但是,BMP3对粪便样品的检测准确性的贡献非常有限。此外,甲基化的SEPT9,NDRG4和SDC2的组合表现出高可见的CRC和腺瘤的可行性,并且进一步的研究表明,检测CRC的性能比腺瘤更好。我们的研究还表明,不同种族之间的粪便基因差异。

这项研究旨在通过CRC患者和健康对照组之间的16S rRNA分析来检测粪便中的肠道菌群差异。它将结合粪便去角质细胞的DNA分析,以进一步阐明这种差异,以构建一些模型,以筛选中国人的早期结直肠癌。同时,该研究还将研究中国饮食习惯对肠道菌群的影响。

研究类型观察
学习规划观察模型:病例对照
时间观点:回顾
目标随访时间不提供
生物测量保留:DNA样品
描述:
在结肠镜检查之前,从参与者那里收集粪便样品。要求参与者在标准化容器中收集粪便样品,然后立即将其存储在-80ºC。
采样方法非概率样本
研究人群

该计划是在中国湖南州长沙(Changsha)的Xiangya医院(仍在招募)进行的。

只有接受结肠镜检查的参与者才被注册

健康)状况
  • 胃肠道微生物组
  • DNA甲基化
  • 结直肠肿瘤
干涉其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
研究组/队列
  • 控制组
    健康对照必须年满18-75岁,没有肿瘤,也没有癌症史。
    干预:其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
  • 测试组
    实验组的纳入标准为18-75岁,结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤,活检确认的腺癌或腺瘤,没有化学疗法或手术,也没有其他癌症史。两组都必须能够理解并愿意签署知情同意。
    干预:其他:粪便菌群检测和去角质细胞基因检测
出版物 *
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*包括由数据提供商提供的出版物以及Medline中临床标识符(NCT编号)的出版物。
招聘信息
招聘状况招募
估计入学人数
(提交:2020年3月6日)
500
原始估计注册与电流相同
估计学习完成日期2021年12月1日
估计的初级完成日期2020年12月1日(主要结果指标的最终数据收集日期)
资格标准

纳入标准:

  • 结肠镜检查显示结肠或直肠肿瘤以及活检确认的腺癌或腺瘤。
  • 没有化​​学疗法或手术,也没有其他癌症的史。
  • 必须能够理解并愿意签署知情同意。
  • 健康对照没有肿瘤和癌症病史。

排除标准:

  • 那些不愿意在研究开始之前提供标本或回答问卷的人。
  • 粪便样品不符合要求的人。
  • 不愿签署书面知情同意书或遵守研究方案的人。
性别/性别
有资格学习的男女:全部
年龄18年至75岁(成人,老年人)
接受健康的志愿者不提供
联系人
联系人:Weidong Liu,博士86-13873124855 weidong.liu@csu.edu.cn
联系人:Mingmei Liao,博士86-15388023797 mingmeiliao@csu.edu.cn
列出的位置国家中国
删除了位置国家
管理信息
NCT编号NCT04302363
其他研究ID编号CCRS-2
有数据监测委员会是的
美国FDA调节的产品
研究美国FDA调节的药物:
研究美国FDA调节的设备产品:
IPD共享声明
计划共享IPD:不确定
计划描述:数据共享不适用于本文,因为在当前研究期间未生成或分析数据集。数据将以数字形式保存在Excel形式中,图像将以PNG格式保存。所有数据将保存由WEI教授保存。 - 刘。
责任方中央南大学西安加利亚医院医学博士Weidong Liu
研究赞助商魏登·刘,医学博士
合作者湖南省自然科学基金会
调查人员
学习主席: Weidong Liu,博士中央南大学的木安医院
研究主任: Mingmei Liao,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: XI Xie,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Jie Chen,博士中央南大学的木安医院
首席研究员: Zhan QU,博士中央南大学的木安医院
PRS帐户中央南大学的木安医院
验证日期2020年3月

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