• 整个队列中的SF3B1状态（n = 200）[时间范围：1天]
  在所有情况下，将通过Sanger测序分析SF3B1基因。
• 对MDS的深层测序分析低风险病例，显示出疾病进展（n = 20）[时间范围：1天]
  那些表现出疾病进展的病例将通过NGS进行回顾性分析。估计10％的患者可以进展，预计每年将包括10名新患者（在项目的两年中）在分子分析中。这是2年后随访后共有20名患者。在诊断和进展时，将在整个BM和PB配对样品的DNA中进行靶向深测序（40个相关基因的面板）。两次之间的三个PB随访样本也将进行分析，以跟踪克隆动力学。这说明了每位进展的每位患者共有7个样本。
• 对MD的低风险病例的有针对性的深层测序分析保持稳定（疾病没有进展）（n = 20）[时间范围：1天]
  将分析20例没有进展的患者，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。对于这些非促进案例，考虑到进展的案件的同一时间点。

骨髓塑性综合征（MDS）是一组克隆造血干细胞恶性肿瘤。体细胞遗传学和分子畸变以及亚克隆恶性细胞群体的演变负责MDS向急性髓样白血病的发展和发展。

在短短十年内，像下一代测序（NGS）这样的全基因组技术的可用性彻底改变了基础研究。 NGS分析的常规临床使用以及建立的诊断工具（如染色体带分析或原位杂交）将大大增加现有的诊断和预后标准。这种全面的组合方法可以彻底改变我们管理患者护理的方式。但是，对于此类技术在常规诊断和标准中用于此类分析的应用知之甚少。

在研究小组的最新出版物（文章DOI：10.1002/ajh.25089）中，证明了NGS对外围血细胞（诊断）的分析是可行的，并且产生与从骨髓获得的结果相等的数据细胞（BMC），这是大多数分子诊断分析的黄金标准。

不再取决于严重和患者的痛苦收集骨髓抽吸物，我们现在能够短时间间隔对MDS患者的外周血进行全面的遗传分析，以检测并密切监测恶性细胞种群克隆进化的模式/途径在常规诊断设置中。预计从这项研究中获得的数据将大大添加到：

1. 了解已识别突变的功能相关性以及组合突变的含义。
2. 将NGS的发现与来自已建立的遗传学方法（常规细胞遗传学，鱼类）的数据一起凝结到有关MDS遗传学及其动态的全面观点，即考虑到这种方法的每个组成部分的优势和缺点。
3. 证明外周血可能是进行NGS随访研究的合适样本。

在一系列来自西班牙的非常低，低和中级风险的MDS患者中，旨在回顾性地对诊断和连续的随访样本进行NGS（有针对性的深层测序），以选择那些显示出疾病进展迹象的病例。

骨髓塑性综合征（MDS）是一组克隆造血干细胞恶性肿瘤。体细胞遗传学和分子畸变以及亚克隆恶性细胞群体的演变负责MDS向急性髓样白血病的发展和发展。

在短短十年内，像下一代测序（NGS）这样的全基因组技术的可用性彻底改变了基础研究。 NGS分析的常规临床使用以及建立的诊断工具（如染色体带分析或原位杂交）将大大增加现有的诊断和预后标准。这种全面的组合方法可以彻底改变我们管理患者护理的方式。但是，对于此类技术在常规诊断和标准中用于此类分析的应用知之甚少。

在研究小组的最新出版物（文章DOI：10.1002/ajh.25089）中，证明了NGS对外围血细胞（诊断）的分析是可行的，并且产生与从骨髓获得的结果相等的数据细胞（BMC），这是大多数分子诊断分析的黄金标准。

不再取决于严重和患者的痛苦收集骨髓抽吸物，我们现在能够短时间间隔对MDS患者的外周血进行全面的遗传分析，以检测并密切监测恶性细胞种群克隆进化的模式/途径在常规诊断设置中。预计从这项研究中获得的数据将大大添加到：

1. 了解已识别突变的功能相关性以及组合突变的含义。
2. 将NGS的发现与来自已建立的遗传学方法（常规细胞遗传学，鱼类）的数据一起凝结到有关MDS遗传学及其动态的全面观点，即考虑到这种方法的每个组成部分的优势和缺点。
3. 证明外周血可能是进行NGS随访研究的合适样本。

在一系列来自西班牙的非常低，低和中级风险的MDS患者中，旨在回顾性地对诊断和连续的随访样本进行NGS（有针对性的深层测序），以选择那些显示出疾病进展迹象的病例。

方法

考虑到该地区MDS的发生率，计划每年（在项目的前2年中）从100名MDS患者中收集样品，归类为非常低，低和中间风险。

所有收集的样品将通过常规细胞遗传学（通常作为诊断测试的一部分进行）分析，并将进行SF3B1突变分析，以筛选低风险患者的常见变化。通过这种方式，可以更好地对患者进行更好的表征，并根据每个患者的风险进行个性化治疗选择。

根据文献，预计约5-15％的人会发展到高/高风险的MDS亚型或急性髓样白血病（AML）。只有那些显示出疾病进展迹象的病例才能通过NGS进行追溯分析。

将为患者入学时采用以下标准：

纳入标准：

• 根据修订后的MDS（IPSS-R）修订的国际预后评分系统，将患者归类为非常低，低或中间的风险。
• 符合先前标准并且不接受任何治疗或仅接受支持护理的患者（接受促红细胞生成素）。

排除标准：

• 根据2017年世界卫生组织分类（WHO），患有“孤立DEL（5Q）的MD”诊断患者。
• 接受任何修饰疗法的疾病的患者（例如，甲基化剂）。

进展的定义：向高/高风险MDS亚型或AML演变。

诊断时，将收集并存储外周血（PB）和骨髓（BM）样品。 PB样品将每6个月收集一次，并在疾病进展时（在接受任何治疗之前）BM样品。

DNA提取将在诊断BM样品中进行，并在所有情况下通过Sanger测序分析SF3B1基因。

NGS估计总共有40例病例，预计将显示20例患者的疾病进展和20例没有进展的患者：

• 那些表现出疾病进展的病例将通过NGS进行回顾性分析。估计10％的患者可以进展，预计每年将包括10名新患者（在项目的两年中）在分子分析中。这是2年后随访后共有20名患者。
• NGS将在诊断和进展时从整个BM和PB配对样品中进行DNA进行。两次之间的三个PB随访样本也将进行分析，以跟踪克隆动力学。这说明了每位进展的每位患者总共7个样本（图1）。
• 此外，将分析20名没有进展的患者，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。对于这些非促进案例，考虑到进展的案件的同一时间点。

将研究包括以下40个基因的疾病相关区域在内的基因小组：

ASXL1, ASXL2, BCOR, BCORL1, BRAF, CALR, CBL, CEBPA, CSF3R, CSNK1A1, DNMT3A, EZH2, ETV6, FLT3, GATA1, GATA2, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KMT2A (MLL), KRAS, MPL, NF1 ，NPM1，NRA，PTPN11，RAD21，RUNX1，SETBP1，SF3B1，SMC3，SRSF2，Stag1，Stag1，Tet2，Tet2，TP53，U2AF1，WT1，WT1，ZRSR2。

患者和相关样本数据将在独特的数据库中注册。所有临床数据将根据西班牙骨髓增生综合征（GESMD）定义的参数收集。将要求所有参加该项目的患者填写并签署一份知情同意书，以获得由ICO院德国人Trias I Pujol（巴塞罗那，巴塞罗那，西班牙）批准的研究目的。所有协议将符合赫尔辛基的宣言和数据的保密性（LOPD）。

生物信息学分析将在Josep Carreras白血病研究所（IJC校园ICO-GTIP。西班牙Badalona）进行。由于数据量，每个分析都需要在集群计算中心进行，并存储在特殊的存储系统中，该系统遵循西班牙的当前法律。

• 骨髓增生综合征 - 进展队列
  根据文献（Greenberg等人，Blood。2012），预计约5-15％会发展到高/高风险的MDS亚型或急性髓样白血病（AML）。根据患者的总体总体，预计其中20个将构成这一组，并​​通过针对性深层测序进行研究。
• 骨髓增生综合征 - 非进展队列
  20名没有进展的患者将通过靶向深度测序分析，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。

纳入标准：

• 根据修订后的MDS（IPSS-R）修订的国际预后评分系统，将患者归类为非常低，低或中间的风险。
• 符合先前标准并且不接受任何治疗或仅接受支持护理的患者（接受促红细胞生成素）。

排除标准：

• 根据2017年世界卫生组织分类（WHO），患有“孤立DEL（5Q）的MD”诊断患者。
• 接受任何修饰疗法的疾病的患者（例如，甲基化剂）。

• 整个队列中的SF3B1状态（n = 200）[时间范围：1天]
  在所有情况下，将通过Sanger测序分析SF3B1基因。
• 对MDS的深层测序分析低风险病例，显示出疾病进展（n = 20）[时间范围：1天]
  那些表现出疾病进展的病例将通过NGS进行回顾性分析。估计10％的患者可以进展，预计每年将包括10名新患者（在项目的两年中）在分子分析中。这是2年后随访后共有20名患者。在诊断和进展时，将在整个BM和PB配对样品的DNA中进行靶向深测序（40个相关基因的面板）。两次之间的三个PB随访样本也将进行分析，以跟踪克隆动力学。这说明了每位进展的每位患者共有7个样本。
• 对MD的低风险病例的有针对性的深层测序分析保持稳定（疾病没有进展）（n = 20）[时间范围：1天]
  将分析20例没有进展的患者，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。对于这些非促进案例，考虑到进展的案件的同一时间点。

骨髓塑性综合征（MDS）是一组克隆造血干细胞恶性肿瘤。体细胞遗传学和分子畸变以及亚克隆恶性细胞群体的演变负责MDS向急性髓样白血病的发展和发展。

在短短十年内，像下一代测序（NGS）这样的全基因组技术的可用性彻底改变了基础研究。 NGS分析的常规临床使用以及建立的诊断工具（如染色体带分析或原位杂交）将大大增加现有的诊断和预后标准。这种全面的组合方法可以彻底改变我们管理患者护理的方式。但是，对于此类技术在常规诊断和标准中用于此类分析的应用知之甚少。

在研究小组的最新出版物（文章DOI：10.1002/ajh.25089）中，证明了NGS对外围血细胞（诊断）的分析是可行的，并且产生与从骨髓获得的结果相等的数据细胞（BMC），这是大多数分子诊断分析的黄金标准。

不再取决于严重和患者的痛苦收集骨髓抽吸物，我们现在能够短时间间隔对MDS患者的外周血进行全面的遗传分析，以检测并密切监测恶性细胞种群克隆进化的模式/途径在常规诊断设置中。预计从这项研究中获得的数据将大大添加到：

1. 了解已识别突变的功能相关性以及组合突变的含义。
2. 将NGS的发现与来自已建立的遗传学方法（常规细胞遗传学，鱼类）的数据一起凝结到有关MDS遗传学及其动态的全面观点，即考虑到这种方法的每个组成部分的优势和缺点。
3. 证明外周血可能是进行NGS随访研究的合适样本。

在一系列来自西班牙的非常低，低和中级风险的MDS患者中，旨在回顾性地对诊断和连续的随访样本进行NGS（有针对性的深层测序），以选择那些显示出疾病进展迹象的病例。

骨髓塑性综合征（MDS）是一组克隆造血干细胞恶性肿瘤。体细胞遗传学和分子畸变以及亚克隆恶性细胞群体的演变负责MDS向急性髓样白血病的发展和发展。

在短短十年内，像下一代测序（NGS）这样的全基因组技术的可用性彻底改变了基础研究。 NGS分析的常规临床使用以及建立的诊断工具（如染色体带分析或原位杂交）将大大增加现有的诊断和预后标准。这种全面的组合方法可以彻底改变我们管理患者护理的方式。但是，对于此类技术在常规诊断和标准中用于此类分析的应用知之甚少。

在研究小组的最新出版物（文章DOI：10.1002/ajh.25089）中，证明了NGS对外围血细胞（诊断）的分析是可行的，并且产生与从骨髓获得的结果相等的数据细胞（BMC），这是大多数分子诊断分析的黄金标准。

不再取决于严重和患者的痛苦收集骨髓抽吸物，我们现在能够短时间间隔对MDS患者的外周血进行全面的遗传分析，以检测并密切监测恶性细胞种群克隆进化的模式/途径在常规诊断设置中。预计从这项研究中获得的数据将大大添加到：

1. 了解已识别突变的功能相关性以及组合突变的含义。
2. 将NGS的发现与来自已建立的遗传学方法（常规细胞遗传学，鱼类）的数据一起凝结到有关MDS遗传学及其动态的全面观点，即考虑到这种方法的每个组成部分的优势和缺点。
3. 证明外周血可能是进行NGS随访研究的合适样本。

在一系列来自西班牙的非常低，低和中级风险的MDS患者中，旨在回顾性地对诊断和连续的随访样本进行NGS（有针对性的深层测序），以选择那些显示出疾病进展迹象的病例。

方法

考虑到该地区MDS的发生率，计划每年（在项目的前2年中）从100名MDS患者中收集样品，归类为非常低，低和中间风险。

所有收集的样品将通过常规细胞遗传学（通常作为诊断测试的一部分进行）分析，并将进行SF3B1突变分析，以筛选低风险患者的常见变化。通过这种方式，可以更好地对患者进行更好的表征，并根据每个患者的风险进行个性化治疗选择。

根据文献，预计约5-15％的人会发展到高/高风险的MDS亚型或急性髓样白血病（AML）。只有那些显示出疾病进展迹象的病例才能通过NGS进行追溯分析。

将为患者入学时采用以下标准：

纳入标准：

• 根据修订后的MDS（IPSS-R）修订的国际预后评分系统，将患者归类为非常低，低或中间的风险。
• 符合先前标准并且不接受任何治疗或仅接受支持护理的患者（接受促红细胞生成素）。

排除标准：

• 根据2017年世界卫生组织分类（WHO），患有“孤立DEL（5Q）的MD”诊断患者。
• 接受任何修饰疗法的疾病的患者（例如，甲基化剂）。

进展的定义：向高/高风险MDS亚型或AML演变。

诊断时，将收集并存储外周血（PB）和骨髓（BM）样品。 PB样品将每6个月收集一次，并在疾病进展时（在接受任何治疗之前）BM样品。

DNA提取将在诊断BM样品中进行，并在所有情况下通过Sanger测序分析SF3B1基因。

NGS估计总共有40例病例，预计将显示20例患者的疾病进展和20例没有进展的患者：

• 那些表现出疾病进展的病例将通过NGS进行回顾性分析。估计10％的患者可以进展，预计每年将包括10名新患者（在项目的两年中）在分子分析中。这是2年后随访后共有20名患者。
• NGS将在诊断和进展时从整个BM和PB配对样品中进行DNA进行。两次之间的三个PB随访样本也将进行分析，以跟踪克隆动力学。这说明了每位进展的每位患者总共7个样本（图1）。
• 此外，将分析20名没有进展的患者，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。对于这些非促进案例，考虑到进展的案件的同一时间点。

将研究包括以下40个基因的疾病相关区域在内的基因小组：

ASXL1, ASXL2, BCOR, BCORL1, BRAF, CALR, CBL, CEBPA, CSF3R, CSNK1A1, DNMT3A, EZH2, ETV6, FLT3, GATA1, GATA2, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KMT2A (MLL), KRAS, MPL, NF1 ，NPM1，NRA，PTPN11，RAD21，RUNX1，SETBP1，SF3B1，SMC3，SRSF2，Stag1，Stag1，Tet2，Tet2，TP53，U2AF1，WT1，WT1，ZRSR2。

患者和相关样本数据将在独特的数据库中注册。所有临床数据将根据西班牙骨髓增生综合征（GESMD）定义的参数收集。将要求所有参加该项目的患者填写并签署一份知情同意书，以获得由ICO院德国人Trias I Pujol（巴塞罗那，巴塞罗那，西班牙）批准的研究目的。所有协议将符合赫尔辛基的宣言和数据的保密性（LOPD）。

生物信息学分析将在Josep Carreras白血病研究所（IJC校园ICO-GTIP。西班牙Badalona）进行。由于数据量，每个分析都需要在集群计算中心进行，并存储在特殊的存储系统中，该系统遵循西班牙的当前法律。

• 骨髓增生综合征 - 进展队列
  根据文献（Greenberg等人，Blood。2012），预计约5-15％会发展到高/高风险的MDS亚型或急性髓样白血病（AML）。根据患者的总体总体，预计其中20个将构成这一组，并​​通过针对性深层测序进行研究。
• 骨髓增生综合征 - 非进展队列
  20名没有进展的患者将通过靶向深度测序分析，以找出与这些疾病进展病例相比，突变谱是否存在任何差异。

纳入标准：

• 根据修订后的MDS（IPSS-R）修订的国际预后评分系统，将患者归类为非常低，低或中间的风险。
• 符合先前标准并且不接受任何治疗或仅接受支持护理的患者（接受促红细胞生成素）。

排除标准：

• 根据2017年世界卫生组织分类（WHO），患有“孤立DEL（5Q）的MD”诊断患者。
• 接受任何修饰疗法的疾病的患者（例如，甲基化剂）。