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与医院爆发研究（NOSO-COVID）的共同基因组测序（NOSO-COVID）
研究描述
简要摘要：
这是加拿大蒙特利尔的一项基于三级医院的前瞻性分子流行病学研究。当局部感染控制小组的调查怀疑医院的传播时，SARS-COV-2病毒基因组测序均针对所有推定的暴发病例和当代控制。实时面临分子和常规流行病学数据，以提高对COVID-19的理解，并加强或适应预防措施。
| 病情或疾病 | 干预/治疗 |
|---|---|
| 联想19分子序列变异医院感染 | 诊断测试：SARS-COV-2基因组测序 |
详细说明：
这项研究将包括受感染的医护人员（HCW）和怀疑CHUM中医院感染的患者。 CHUM实验室负责所有合格的HCW和患者的COVID-19诊断测试。在对标准PCR测试进行初步诊断后，将样品保持在-80。提取病毒RNA，并使用纳米长读取测序平台进行病毒基因组的下一代测序。初步数据表明，SARS-COV-2的“分子钟”每月为2个单核苷酸多态性（SNP）。在流行病学相关的病例中，这些SNP的分析和隔离比较将允许支持或驳斥人对人类医院的传播的假设。所有受感染的患者将以1：1与当代社区病例相匹配，以提供病毒基因组后目录，并更好地对分子流行病学分析进行更好的背景化。将据报道分子簇预防和控制小组，并将监测由此产生的干预措施。
学习规划
| 研究类型 ： | 观察 |
| 估计入学人数 ： | 150名参与者 |
| 观察模型： | 队列 |
| 时间观点： | 预期 |
| 官方标题： | 按需指导SARS-COV-2基因组测序以支持医院爆发研究：蒙特利尔的前瞻性分子流行病学研究 |
| 实际学习开始日期 ： | 2020年11月9日 |
| 估计初级完成日期 ： | 2023年12月31日 |
| 估计 学习完成日期 ： | 2023年12月31日 |
武器和干预措施
结果措施
主要结果指标 ：
- 爆发控制措施改善[时间范围：通过研究完成，平均2年]合作（感染控制和分子流行病学小组）解决了推定的暴发。分子分析被驳斥或进一步支持。额外的调查工作将停止或采取必要的纠正措施。
生物测量保留率：DNA样品
来自患者和医护人员的鼻咽拭子。保留在PCR或SARS-COV-2上呈阳性的主要样品。
资格标准
联系人和位置
| 追踪信息 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 首先提交日期 | 2022年6月2日 | ||||||||
| 第一个发布日期 | 2022年6月9日 | ||||||||
| 最后更新发布日期 | 2022年6月9日 | ||||||||
| 实际学习开始日期 | 2020年11月9日 | ||||||||
| 估计初级完成日期 | 2023年12月31日（主要结果指标的最终数据收集日期） | ||||||||
| 当前的主要结果指标 | 爆发控制措施改善[时间范围：通过研究完成，平均2年] 合作（感染控制和分子流行病学小组）解决了推定的暴发。分子分析被驳斥或进一步支持。额外的调查工作将停止或采取必要的纠正措施。 | ||||||||
| 原始主要结果指标 | 与电流相同 | ||||||||
| 改变历史 | 没有发布更改 | ||||||||
| 当前的次要结果指标 | 不提供 | ||||||||
| 原始的次要结果指标 | 不提供 | ||||||||
| 当前其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||||||
| 其他其他预先指定的结果指标 | 不提供 | ||||||||
| 描述性信息 | |||||||||
| 简短标题 | 与医院爆发研究的共同基因组测序 | ||||||||
| 官方头衔 | 按需指导SARS-COV-2基因组测序以支持医院爆发研究：蒙特利尔的前瞻性分子流行病学研究 | ||||||||
| 简要摘要 | 这是加拿大蒙特利尔的一项基于三级医院的前瞻性分子流行病学研究。当局部感染控制小组的调查怀疑医院的传播时，SARS-COV-2病毒基因组测序均针对所有推定的暴发病例和当代控制。实时面临分子和常规流行病学数据，以提高对COVID-19的理解，并加强或适应预防措施。 | ||||||||
| 详细说明 | 这项研究将包括受感染的医护人员（HCW）和怀疑CHUM中医院感染的患者。 CHUM实验室负责所有合格的HCW和患者的COVID-19诊断测试。在对标准PCR测试进行初步诊断后，将样品保持在-80。提取病毒RNA，并使用纳米长读取测序平台进行病毒基因组的下一代测序。初步数据表明，SARS-COV-2的“分子钟”每月为2个单核苷酸多态性（SNP）。在流行病学相关的病例中，这些SNP的分析和隔离比较将允许支持或驳斥人对人类医院的传播的假设。所有受感染的患者将以1：1与当代社区病例相匹配，以提供病毒基因组后目录，并更好地对分子流行病学分析进行更好的背景化。将据报道分子簇预防和控制小组，并将监测由此产生的干预措施。 | ||||||||
| 研究类型 | 观察 | ||||||||
| 学习规划 | 观察模型：队列 时间观点：前瞻性 | ||||||||
| 目标随访时间 | 不提供 | ||||||||
| 生物测量 | 保留：DNA样品 描述： 来自患者和医护人员的鼻咽拭子。保留在PCR或SARS-COV-2上呈阳性的主要样品。 | ||||||||
| 采样方法 | 非概率样本 | ||||||||
| 研究人群 | 在研究期间，该机构的患者和医护人员。 | ||||||||
| 健康）状况 |
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| 干涉 | 诊断测试：SARS-COV-2基因组测序 SARS-COV-2病毒基因组测序和系统发育分析 | ||||||||
| 研究组/队列 | 不提供 | ||||||||
| 出版物 * | 不提供 | ||||||||
*包括数据提供商提供的出版物以及MEDLINE中临床标识符（NCT编号）确定的出版物。 | |||||||||
| 招聘信息 | |||||||||
| 招聘状况 | 招募 | ||||||||
| 估计入学人数 | 150 | ||||||||
| 原始估计注册 | 与电流相同 | ||||||||
| 估计学习完成日期 | 2023年12月31日 | ||||||||
| 估计初级完成日期 | 2023年12月31日（主要结果指标的最终数据收集日期） | ||||||||
| 资格标准 | 纳入标准：
排除标准：
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| 性别/性别 |
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| 年龄 | 18年至100年（成人，老年人） | ||||||||
| 接受健康的志愿者 | 是的 | ||||||||
| 联系人 |
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| 列出的位置国家 | 加拿大 | ||||||||
| 删除了位置国家 | |||||||||
| 管理信息 | |||||||||
| NCT编号 | NCT05411562 | ||||||||
| 其他研究ID编号 | Noso-Covid-2021-9253，20.270 | ||||||||
| 有数据监测委员会 | 不提供 | ||||||||
| 美国FDA调节的产品 | 不提供 | ||||||||
| IPD共享声明 |
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| 现任负责方 | 中心医院德蒙特利尔大学（CHUM） | ||||||||
| 原始负责方 | 与电流相同 | ||||||||
| 当前的研究赞助商 | 中心医院德蒙特利尔大学（CHUM） | ||||||||
| 原始研究赞助商 | 与电流相同 | ||||||||
| 合作者 |
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| 调查人员 |
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| PRS帐户 | 中心医院德蒙特利尔大学（CHUM） | ||||||||
| 验证日期 | 2022年6月 | ||||||||